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Polinucleótidos
Dos nucleótidos pueden unirse a través de un enlace fosfodiéster. En la representación de polinucleótidos es frecuente, al igual que en el caso de las proteínas, no representar los átomos de hidrógeno. Veamos un Nucleósido:
Al ser un desoxinucleósido, puede estar fosforilado en 3' y 5'. Supongamos que está fosforilado en 3':
Tenemos entonces en pantalla un tetranucleótido. Convencionalmente los polinucleótidos se numeran desde el residuo 5' terminal, que es aquel que tiene un 5'-OH libre (extremo 5'):
5'- ACGC - 3'
O simplemente, ACGC. Hemos de tener en cuenta que el grado de polimerización de los polinucleótidos llega a ser altísimo, con cientos de millones de nucleótidos en los DNAs genómicos. Veamos, por ejemplo, el DNA de un nucleosoma, teniendo en cuenta que un genoma eucariótico puede contar con millones de nucleosomas: