http://hdl.handle.net/10366/130162 2026-04-30T22:38:41Z 2026-04-30T22:38:41Z González Dominici, Lihuén Irai http://hdl.handle.net/10366/169842 2026-02-19T02:09:51Z 2025-01-01T00:00:00Z

[ES] El uso indiscriminado de fertilizantes y pesticidas químicos en los sistemas agrícolas ha provocado una degradación progresiva de la calidad del suelo, alteraciones en la estructura y funcionalidad de las comunidades microbianas, así como la contaminación de otros ecosistemas. Frente a esta problemática ambiental, las bacterias promotoras del crecimiento vegetal (PGPB) se presentan como una alternativa biotecnológica sostenible, con el potencial de mantener o incluso mejorar el rendimiento de los cultivos sin comprometer la salud del ecosistema. El potencial de las PGPB se basa en diversos mecanismos, entre los que se destacan la colonización eficiente de tejidos vegetales en uno o varios hospedadores, la capacidad de facilitar la disponibilidad de nutrientes esenciales y la modulación de los niveles hormonales en las plantas. A través de estos mecanismos, dichas bacterias pueden influir de manera determinante en procesos fisiológicos clave, tales como la modificación de la arquitectura del sistema radicular, lo que favorece la adaptación del hospedador a su entorno, potencia interacciones sinérgicas con otros microorganismos beneficiosos y promueve una mayor resistencia frente a condiciones adversas como sequía o la salinidad. Las cepas bacterianas que presentan estas características se consideran candidatas para el desarrollo de bioinoculantes, susceptibles de ser formulados, producidos a escala industrial, distribuidos y aplicados en sistemas agrícolas. No obstante, los buenos resultados de estos bioinoculantes in vitro no garantizan la efectividad del producto bajo condiciones reales. Por tanto, durante el proceso de formulación es indispensable evaluar aspectos críticos como la estabilidad del producto, su vida útil y, fundamentalmente, su eficacia bajo condiciones no controladas. En este contexto, la cepa Pseudomonas sp. CDVBN10, endófito de raíces de colza, ha demostrado tener potencial como PGPB. Análisis genómicos y bioquímicos han evidenciado su capacidad para producir sideróforos, solubilizar fosfatos, sintetizar ácido indol-3-acético (AIA), presentar actividad ACC desaminasa y formar biofilm en la superficie radicular. Ensayos funcionales adicionales confirmaron su eficacia para promover el crecimiento de colza y cultivos hortícolas como espinaca y cilantro (Jiménez-Gómez, 2020; Jiménez-Gómez et al., 2020). La cepa CDVBN10-B deriva de la cepa CDVBN10, pero cuenta con una deleción genómica de origen desconocido que fue descubierta tras finalizar la presente tesis doctoral. No obstante, nuestros estudios han demostrado que esta cepa sigue manifestando las citadas propiedades. El objetivo general de la presente tesis doctoral es profundizar en la caracterización funcional de la cepa Pseudomonas sp. CDVBN10-B como un bioinoculante de amplio espectro. Para ello, se plantea la caracterización exhaustiva de su potencial como PGPB en cultivos de interés agronómico, la evaluación de los mecanismos moleculares implicados en su interacción con la planta, la remodelación de la arquitectura radicular y la inducción de resistencia sistémica, así como el diseño de un bioinoculante efectivo para su aplicación en condiciones de campo.; [EN] The indiscriminate use of chemical fertilizers and pesticides in agricultural systems has led to progressive soil degradation, disruptions in the structure and functionality of microbial communities, and contamination of surrounding ecosystems. In response to this environmental challenge, plant growth-promoting bacteria (PGPB) have emerged as a sustainable biotechnological alternative with the potential to maintain or even enhance crop yields without compromising ecosystem health. The potential of PGPB relies on several mechanisms, including efficient colonization of plant tissues in one or more hosts, enhanced availability of essential nutrients, and modulation of plant hormone levels. Through these mechanisms, PGPB can significantly influence key physiological processes such as the modification of root system architecture, thereby improving host adaptation to environmental conditions, facilitating synergistic interactions with other beneficial microorganisms, and enhancing tolerance to abiotic stresses such as drought and salinity. Bacterial strains exhibiting these traits are considered suitable candidates for the development of bioinoculants that can be formulated, produced at an industrial scale, distributed, and applied in agricultural systems. However, successful in vitro performance does not necessarily guarantee product effectiveness under field conditions. Thus, formulation development must include the assessment of critical factors such as product stability, shelf life, and, above all, efficacy under non-controlled environments. In this context, Pseudomonas sp. CDVBN10, an endophyte isolated from rapeseed roots, has demonstrated potential as PGPB. Genomic and biochemical analyses revealed its ability to produce siderophores, solubilize phosphate, synthesize indole-3-acetic acid (IAA), exhibit ACC deaminase activity, and form biofilms on root surfaces. Additional functional assays confirmed its capacity to promote the growth of rapeseed and horticultural crops such as spinach and coriander (Jiménez-Gómez, 2020; Jiménez-Gómez et al., 2020). CDVBN10-B, a derivative of strain CDVBN10, was later found to harbor a genomic deletion of unknown origin, identified upon completion of this doctoral thesis. Nevertheless, our studies have shown that this strain retains the aforementioned properties. The overall objective of this doctoral thesis is to conduct an in-depth functional characterization of Pseudomonas sp. CDVBN10-B as a broad-spectrum bioinoculant. This includes a comprehensive evaluation of its potential as PGPB in crops of agronomic interest, investigation of the molecular mechanisms involved in its interaction with host plants, its role in remodeling root architecture and inducing systemic resistance, and the development of an effective bioinoculant suitable for field application.

2025-01-01T00:00:00Z García Rodríguez, Pablo http://hdl.handle.net/10366/169778 2026-02-15T03:03:29Z 2025-01-01T00:00:00Z

[ES] Colletotrichum es un género de hongos filamentosos fitopatógenos que causan la enfermedad de la antracnosis. Colletotrichum graminicola es el agente causal de la antracnosis del maíz (Zea mays), una enfermedad de gran impacto económico cuya incidencia está en aumento en distintas regiones del mundo y cuyos principales síntomas son el tizón foliar y la pudrición del tallo. Su éxito infeccioso depende en gran medida de la acción de proteínas efectoras, muchas de las cuales permanecen poco caracterizadas. Esta Tesis Doctoral se centró en dos efectores nucleares clave que son parálogos entre sí: CgEP4 y CgEP1 (Colletorichum graminicola Effector Protein 4 and 1). El estudio de CgEP4 reveló que se trata de un efector con localización nuclear altamente conservado, originado por una duplicación ancestral, cuya función resulta indispensable para la virulencia. Este gen está altamente conservado entre aislados de campo de C. graminicola de distintos continentes, lo que subraya su importancia biológica. A nivel experimental, se comprobó que CgEP4 se expresa de manera específica durante las fases iniciales de la infección y se transloca al núcleo de las células de maíz. Los mutantes de deleción mostraron una notable reducción en la capacidad de penetración y colonización, así como una activación fuerte de defensas basales en el hospedador, lo que indica que este efector cumple un papel esencial en la supresión de respuestas inmunitarias tempranas. Además, los ensayos in vitro revelaron que su ausencia altera procesos fúngicos fundamentales como el crecimiento, la esporulación y la tolerancia al estrés oxidativo y salino, lo que apunta a una doble función de CgEP4: actuar sobre el hospedador y, al mismo tiempo, regular aspectos internos de la fisiología del hongo. El análisis de CgEP1 se centró en la influencia de las repeticiones en tándem que presenta en su secuencia sobre la virulencia. A partir de un conjunto de aislados naturales se identificaron variantes alélicas que diferían en el número de repeticiones intragénicas (entre 5 y 8), lo que permitió establecer una relación directa entre la arquitectura del gen y la virulencia. Experimentos de complementación funcional demostraron que se requieren al menos siete repeticiones para mantener la virulencia, mientras que alelos con menos repeticiones pierden eficacia infecciosa y se comportan como mutantes nulos. Modelados estructurales realizados con AlphaFold2 confirmaron que la pérdida de repeticiones compromete la estabilidad tridimensional de la proteína, explicando la pérdida de función. A nivel transcriptómico, se comprobó que CgEP1 no solo suprime genes de defensa en las primeras etapas de la infección, sino que también reprograma el metabolismo del maíz en fases posteriores, favoreciendo la colonización. De forma paralela, en el propio hongo regula la expresión de genes asociados a la biosíntesis proteica, al metabolismo energético y a enzimas de degradación de la pared vegetal, reforzando su papel como efector multifuncional capaz de coordinar tanto la respuesta del hospedador como la del patógeno. En conjunto, esta tesis doctoral demuestra que CgEP4 y CgEP1 son efectores nucleares fundamentales para la virulencia de C. graminicola. Ambos casos ilustran la complejidad de las interacciones planta-patógeno y aportan nuevas perspectivas para el diseño de estrategias de control frente a la antracnosis del maíz.

2025-01-01T00:00:00Z Benito-Verdugo, Pilar http://hdl.handle.net/10366/169589 2026-02-08T03:03:23Z 2025-01-01T00:00:00Z

[ES] La agricultura es un sector fundamental en el mundo, destacando los cereales como el grupo de cultivos más relevante. En este contexto, los sistemas de secano adquieren especial importancia, ya que representan la mayor parte de las tierras cultivadas. Sin embargo, la alta vulnerabilidad climática de estos sistemas plantea desafíos importantes, especialmente en regiones como la mediterránea, reconocida como una de las zonas más sensibles al cambio climático global. La humedad del suelo (soil moisture, SM) es una variable crucial en esta región, ya que constituye el principal factor limitante que influye directamente en procesos hidrológicos, fenológicos y productivos. Además, es determinante en la caracterización de fenómenos extremos como las sequías agrícolas, cuya incidencia afecta de forma inmediata al rendimiento de los cultivos y compromete la seguridad alimentaria. Dentro de estos fenómenos, las sequías repentinas (flash droughts, FD) caracterizadas por su rápida intensificación, han generado un creciente interés en los últimos años, ya que representan una amenaza cada vez mayor para los cultivos. A pesar del reconocimiento generalizado de la influencia de la SM en la productividad agrícola y su importancia para la identificación de las sequías, su utilización como indicador en estudios de impacto sobre los cultivos es limitada. Su escasa utilización, junto con la falta de una aplicación específica en áreas vulnerables y en vegetación de interés agronómico, evidencia la necesidad de avanzar hacia investigaciones que aborden de manera integral los efectos del estrés hídrico en la agricultura. Partiendo de esta hipótesis, el objetivo de la presente tesis doctoral fue analizar el impacto de las sequías agrícolas sobre la fenología y la producción del cereal en regiones bajo condiciones mediterráneas. Para lograr este propósito, se plantearon tres objetivos específicos. En primer lugar, se destaca la necesidad de analizar el impacto de la sequía agrícola sobre el rendimiento de los cultivos. A pesar del marcado efecto negativo que los déficits de SM tienen sobre los cultivos, son escasos los estudios que utilizan la SM como variable para identificar este tipo de sequía, a pesar de ser el indicador que la define. En este contexto, el primer objetivo de esta tesis doctoral es analizar y comparar el impacto de la sequía agrícola sobre el rendimiento del trigo y la cebada en las principales regiones cerealistas de España y Alemania, caracterizadas por contrastadas condiciones climáticas, durante el periodo 2001-2020. Para ello, se utilizó la SM de la zona radicular, extraída de la base de datos del modelo LISFLOOD, y se emplearon sus anomalías como índice de sequía agrícola. Además, se identificó el mes en el que la SM ejercía una mayor influencia sobre las variables de estado del cultivo, como la productividad primaria bruta (gross primary productivity, GPP) y el índice de área foliar (leaf area index, LAI), obtenidas del sensor MODIS. Los años de sequía agrícola y su impacto en el rendimiento de los cereales se determinaron mediante tres enfoques basados en el mes crítico, considerando diferentes periodos de análisis. Para identificar dicho mes, se aplicaron dos metodologías diferentes según las condiciones ambientales de cada país. Las variables del cultivo mostraron una dependencia de la SM, especialmente durante los meses de primavera. Asimismo, se observó que las sequías agrícolas provocaron reducciones relevantes en el rendimiento de los cereales, presentando variaciones en su magnitud que reflejan el contraste entre las condiciones ambientales de cada país. Tanto en las regiones tradicionalmente afectadas por las sequías agrícolas, como en aquellas que hasta hace poco no lo estaban, este estudio proporciona información útil para la gestión del agua y la agricultura ante escenarios de cambio climático. En segundo lugar, se partió de la hipótesis de que la evolución temporal de las principales métricas fenológicas antes y después del comienzo del siglo XXI es incierta. Además, la SM raramente se incorpora en los análisis fenológicos basados en teledetección y la mayoría de los estudios se enfocan en la vegetación natural. Por ello, se definió como segundo objetivo de esta tesis doctoral el análisis de los patrones temporales de la fenología de los cereales de secano, extraídos del conjunto de datos GIMMS NDVI3g en las principales regiones cerealistas bajo clima mediterráneo de España, Portugal, Francia e Italia, durante el periodo 1982-2022. Se analizaron por separado las series temporales anteriores y posteriores al inicio del siglo XXI, extrayendo los parámetros fenológicos mediante el método del umbral dinámico modificado, y se estudiaron sus tendencias. Asimismo, se evaluaron las relaciones entre estos parámetros y la influencia de determinadas variables hidroclimáticas sobre el inicio o siembra (start of season, SOS) y el final o cosecha (end of season, EOS) del ciclo fenológico. Las tendencias fenológicas entre ambos periodos de estudio mostraron una inversión temporal coincidente con la pausa del calentamiento global, reflejándose asimismo en la dinámica de la influencia de las variables hidroclimáticas sobre SOS y EOS. Esta información resulta fundamental para la gestión y planificación de los cultivos de secano en escenarios de cambio climático. El último objetivo parte del creciente interés por las FD debido a su dinámica específica, su rápida generación, desarrollo y los daños significativos que ocasionan. No obstante, a pesar de la creciente evidencia de su amenaza para los cultivos, los estudios en ámbitos agrícolas siguen siendo limitados. En este contexto, se planteó como tercer y último objetivo de esta tesis doctoral el análisis de las FD en las principales regiones cerealistas de España, Portugal, Francia e Italia entre 2000 y 2023, evaluando sus efectos sobre la GPP, el rendimiento y la fenología de los cereales. Las FD se identificaron mediante la SM obtenida de la base de datos de reanálisis ERA5-Land. La respuesta de los cereales se analizó mediante dos índices basados en el tiempo de respuesta de la GPP, mientras que el impacto sobre la fenología del cereal se evaluó usando el NDVI (Normalized Difference Vegetation Index), utilizando datos de MODIS. Se observó que las FD afectaron significativamente a los cereales bajo condiciones mediterráneas, presentando mayor frecuencia e intensidad durante los meses críticos de desarrollo, y provocaron un estrés máximo en los cultivos en dichos periodos. Este análisis aporta información clave para entender la resiliencia de los cultivos frente a las FD y para desarrollar estrategias que mitiguen sus efectos en escenarios futuros de cambio climático.

2025-01-01T00:00:00Z Tello Martín, Maria Luisa http://hdl.handle.net/10366/167322 2025-10-09T01:09:33Z 2025-01-01T00:00:00Z

[ES] El estudio de los hongos y, en particular, de Agaricus bisporus (champiñón de París o champiñón blanco), ha acompañado a la humanidad desde tiempos prehistóricos, atravesando usos rituales, medicinales, culinarios y, en la actualidad, industriales. Esta especie, por su valor nutricional, económico y biotecnológico, es uno de los pilares del cultivo mundial de hongos. El champiñón, es un hongo basidiomiceto ampliamente cultivado y consumido a nivel mundial. Representa una etapa transitoria (el cuerpo fructífero o esporocarpo) de un organismo cuyo ciclo de vida se desarrolla mayormente como una red de filamentos (micelio) que coloniza sustratos orgánicos compostados. Morfológicamente, presenta un sombrero (píleo), láminas (donde se producen las esporas) y un pie (estípite). Es un descomponedor secundario saprofito, especializado en degradar sustratos ricos en lignina y celulosa. El champiñón es un alimento de bajo contenido calórico y rico en proteínas, vitaminas y minerales, con un impacto económico global significativo en la agricultura. Sin embargo, la industria del champiñón se enfrenta a desafíos importantes, como la dependencia en la turba (un recurso no sostenible) como tierra de cobertura, la amenaza constante de enfermedades fúngicas devastadoras como la mole seca (Lecanicillium fungicola), la mole húmeda (Mycogone perniciosa) y la tela de araña (Cladobotryum mycophilum), y un número cada vez más limitado de fungicidas eficaces y permitidos. Además, existe una falta de conocimiento profundo sobre las interacciones hongo (huésped)-hongo (patógeno) a nivel molecular que hace más difícil el desarrollo de nuevas estrategias de control. En este contexto se desarrolla esta tesis, que busca profundizar en la comprensión de la ecología microbiana y las interacciones moleculares subyacentes al cultivo de A. bisporus y su susceptibilidad a las principales enfermedades fúngicas. Al investigar la dinámica de las comunidades microbianas en la cobertura, el impacto de los fungicidas, los cambios en el bacterioma durante la enfermedad y los perfiles transcriptómicos de huésped y patógeno, se busca proporcionar una base científica para desarrollar prácticas de producción mejores, más sostenibles y estrategias de control de enfermedades más efectivas. El capítulo 1 se centra en caracterizar mediante secuenciación de nueva generación (NGS), la estructura de la microbiota (bacteriana y fúngica) de la tierra de cobertura, a base de turba, utilizada en el cultivo de A. bisporus, y cómo esta evoluciona durante la incubación del hongo, así como el efecto de los tratamientos fungicidas clorotalonil y metrafenona. Se observaron cambios estadísticamente significativos en las poblaciones de bacterias y hongos. La composición microbiana se modificó significativamente según el día de incubación, cambiando radicalmente desde las comunidades originales en la materia prima, a una composición microbiana específica impulsada por el crecimiento del micelio de A. bisporus. Los filos bacterianos más dominantes fueron Proteobacteria y Bacteroidota. Se observó un gran cambio en la estructura de las poblaciones bacterianas entre el día 0 y los días siguientes. Las poblaciones de hongos cambiaron más gradualmente, con A. bisporus (familia Agaricaceae, filo Basidiomycota) desplazando al resto de las especies (mayoritariamente del filo Ascomycota inicialmente) a medida que 19 avanzaba el ciclo de cultivo. El tratamiento con clorotalonil, retrasó la colonización de la cobertura por A. bisporus, justificado por una menor proporción de la familia Agaricaceae en las muestras tratadas con este fungicida en comparación con el control y el tratamiento con metrafenona, especialmente en el día 7. Aunque no hubo diferencias significativas en la alfa diversidad entre las comunidades bacterianas entre tratamientos en el día 7, la beta diversidad entre las comunidades fúngicas sí mostró diferencias significativas, sugiriendo un impacto de los fungicidas en la composición general de la comunidad fúngica. Las limitaciones en las bases de datos taxonómicas actuales a menudo no permiten alcanzar una identificación taxonómica a nivel de especie en la mayoría de los casos, lo que restringe la profundidad del análisis.; [EN] The study of fungi, in particular Agaricus bisporus (white button mushroom), has accompanied humanity since prehistoric times, through ritual, medicinal, culinary and, nowadays, industrial uses. This species, due to its nutritional, economic and biotechnological value, is one of the pillars of global mushroom cultivation. The white button mushroom is a basidiomycete fungus that is widely cultivated and consumed worldwide. It represents a transitional stage (the fruiting body or sporocarp) of an organism whose life cycle develops mainly as a network of filaments (mycelium) that colonises composted organic substrates. Morphologically, it has a cap (pileus), gills (where the spores are produced) and a stem (stipe). It is a secondary saprophytic decomposer, specialised in degrading lignin and cellulose rich substrates. Mushrooms are a low-calorie food rich in protein, vitamins and minerals, with a significant global economic impact on agriculture. However, the mushroom industry faces significant challenges, such as dependence on peat (a non-sustainable resource) as casing soil, the constant threat of devastating fungal diseases such as dry bubble (Lecanicillium fungicola), wet bubble (Mycogone perniciosa) and cobweb (Cladobotryum mycophilum), and an increasingly limited number of effective and permitted fungicides. In addition, there is a lack of knowledge about fungus (host)-fungus (pathogen) interactions at the molecular level, which makes it more difficult to develop new control strategies. This thesis was developed in this context and seeks to deepen the understanding of the microbial ecology and molecular interactions underlying the cultivation of A. bisporus and its susceptibility to major fungal diseases. By investigating the dynamics of microbial communities in the casing soil, the impact of fungicides, changes in the bacteriome during disease, and the transcriptomic profiles of host and pathogen, we seek to provide a scientific basis for developing better, more sustainable production practices and more effective disease control strategies. Chapter 1 focuses on characterising, through next-generation sequencing (NGS), the structure of the microbiota (bacterial and fungal) of the peat-based casing soil used in the cultivation of A. bisporus, and how it evolves during the incubation of the fungus, as well as the effect of the fungicide treatments chlorothalonil and metrafenone. Statistically significant changes in bacterial and fungal populations were observed. The microbial composition changed significantly depending on the day of incubation, changing radically from the original communities in the raw material to a specific microbial composition driven by the growth of A. bisporus mycelium. The most dominant bacterial phyla were Proteobacteria and Bacteroidota. A major change in the structure of bacterial populations was observed between day 0 and the following days. Fungal populations changed more gradually, with A. bisporus (family Agaricaceae, phylum Basidiomycota) displacing the rest of the species (initially mainly from the phylum Ascomycota) as the cultivation cycle progressed. Treatment with chlorothalonil delayed the colonisation of the casing soil by A. bisporus, justified by a lower proportion of the Agaricaceae family in the samples treated with this fungicide compared to the control and treatment with metrafenone, especially on day 7. Although there were no significant differences in alpha diversity between bacterial communities between treatments on day 7, beta diversity between fungal communities did show significant differences, suggesting an impact of fungicides on the overall composition of the fungal community. Limitations in current taxonomic databases often do not allow taxonomic identification at the species level in most cases, which restricts the depth of the analysis.

2025-01-01T00:00:00Z Pedrero Méndez, Alberto http://hdl.handle.net/10366/167240 2025-10-02T02:03:48Z 2025-01-01T00:00:00Z

[EN] Current agriculture needs to find a solution for the dilemma of maintaining high productivity to feed the constantly growing population, but in a sustainable way avoiding the indiscriminate use of agrochemicals. Wheat is one of the most important crops for humankind and its production can be affected by several issues including abiotic stresses such as drought, or fungal diseases as Fusarium head blight (FHB) produced by Fusarium spp., including F. graminearum (Fg). These issues also represent a concern in the actual context of climate change, that could worsen such drought conditions and favour the FHB development. Therefore, new solutions as the use of beneficial microorganisms can be a suitable alternative to agrochemicals. Trichoderma is a fungal genus including species that are of interest to agriculture as direct biological control agents (BCA) against different phytopathogens. Trichoderma spp. are able to mycoparasite other fungi, produce secondary metabolites (SMs) and enzymatic activities with effect on fungi, chromists, bacteria, nematodes or insects, and compete for niche and resources. Moreover, these fungi can establish symbiotic relationships with plants activating their local and systemic defences against biotic and abiotic stresses. This PhD thesis has been focused on the interactions of Trichoderma spp. with wheat plants and pathogens, and on the role played by the hexagonal peroxisome protein 1 gene (hex1) in these relationships; having as main objective the selection of Trichoderma strains susceptible of being applied to wheat crops.; [ES] La agricultura actual necesita encontrar una solución al dilema de mantener una alta productividad para alimentar a una población en constante crecimiento, pero de una forma sostenible, evitando el uso indiscriminado de agroquímicos. El trigo, uno de los cultivos más importantes para la humanidad, y su producción, pueden verse afectados por diversas cuestiones, incluyendo estreses abióticos como la sequía o enfermedades como la fusariosis de la espiga (FHB), producida por especies de Fusarium, incluyendo F. graminearum (Fg). Estas cuestiones representan también una preocupación en un contexto de cambio climático, el cual podría agravar las condiciones de sequía y favorecer el desarrollo de la FHB. Por lo tanto, nuevas soluciones como el uso de microorganismos beneficiosos puede ser una alternativa adecuada a los agroquímicos. Trichoderma es un género fúngico que incluye especies usadas como agentes de control biológico (BCA) frente a diferentes fitopatógenos de interés agrícola. Las especies de Trichoderma son capaces de micoparasitar otros hongos, producir metabolitos secundarios (SMs) y actividades enzimáticas con efecto sobre hongos, cromistas, bacterias, nematodos o insectos, y competir por el nicho y los recursos. Además, Trichoderma puede establecer relaciones simbióticas con la planta, activando sus defensas locales y sistémicas frente a estreses bióticos y abióticos. Esta Tesis Doctoral se centró en las interacciones de Trichoderma con plantas de trigo y patógenos, y en el papel que desempeña el gen de la proteína hexagonal del peroxisoma 1 (hex1) en estas relaciones; teniendo como objetivo principal la selección de cepas de Trichoderma susceptibles de ser aplicadas en el cultivo del trigo.

2025-01-01T00:00:00Z Espinosa Saiz, Daniel http://hdl.handle.net/10366/165826 2025-05-24T02:04:02Z 2024-01-01T00:00:00Z

[ES]Existe una gran variedad de microorganismos (bacterias, arqueas, hongos, protistas, etc.) que han sido encontrados en prácticamente todos los ambientes de la Tierra, desde suelos y océanos hasta ambientes extremos como fuentes termales y zonas polares (Amri et al., 2023; Malesevic et al., 2023; Ordóñez-Enireb et al., 2022; Romanenko et al., 2023). Todos ellos juegan un papel importante en la sostenibilidad del ecosistema en el que están presentes mediante diferentes roles. Algunos participan en el ciclo de los nutrientes; ya sea descomponiendo materia orgánica, liberando nutrientes esenciales como nitrógeno, fósforo y carbono, que son reutilizados por otras formas de vida (Pelikan et al., 2021); o mediante la fijación de nitrógeno atmosférico, convirtiendo éste en formas utilizables por las plantas, un proceso crucial para la productividad agrícola y la salud del ecosistema (Sun et al., 2021a).

2024-01-01T00:00:00Z Pollo Rodríguez, Fátima http://hdl.handle.net/10366/163782 2025-04-30T19:44:41Z 2024-12-01T00:00:00Z

[ES]La dormición es la incapacidad de semillas viables para germinar en condiciones favorables. Ventajas: Supervivencia de la planta y adaptación a cambios ambientales. Desventajas en agricultura: Variación en el tiempo de germinación. Reguladores clave: Ácido abscísico (ABA) y DOG1, que afectan la dormición. El óxido nítrico (NO) promueve la germinación y contrarresta el ABA. Se estudia la interacción entre NO y DOG1 para entender la regulación de la dormición.

2024-12-01T00:00:00Z Roca-Couso, Rocío http://hdl.handle.net/10366/160329 2025-04-30T19:41:56Z 2024-01-01T00:00:00Z

[ES]La población humana está en constante crecimiento y, a partir de la Revolución Industrial, experimentó un incremento exponencial descontrolado. La agricultura es la base de la alimentación humana y, para satisfacer la continua demanda de alimentos, ha tenido que evolucionar y mejorar para conseguir cultivos más eficientes. Los fertilizantes y pesticidas químicos son dos de los factores más importantes en la agricultura que aportan los nutrientes necesarios a los cultivos y los protegen de las enfermedades. El uso de los fertilizantes y de los pesticidas ha ido en aumento desde su incorporación a la agricultura. Entre el año 2000 y el 2021, el consumo mundial de fertilizantes aumentó en un 144,3%, mientras que el consumo de los pesticidas aumentó en un 162,3%. En la actualidad, se han descrito una serie de consecuencias negativas relacionadas con la salud ambiental y la humana, derivadas del uso excesivo de los compuestos agroquímicos. El exceso de estos productos que no son absorbidos por las plantas, son acumulados en los suelos. Estos, ya sea por la lluvia, la erosión del suelo, el riego o la infiltración, acaban en las aguas subterráneas y los acuíferos, lo que altera las características fisicoquímicas del agua y la contamina. Además, el uso excesivo de los pesticidas químicos ha dado lugar a la aparición de cepas de microorganismos fitopatógenos resistentes a estos compuestos, los cuales acaban perdiendo su efectividad y capacidad de control. Por esta razón, en los últimos años, las diferentes legislaciones gubernamentales y supragubernamentales se han vuelto más estrictas con respecto al uso de este tipo de compuestos químicos, por lo que es necesaria la búsqueda de alternativas más sostenibles. Una de las alternativas propuestas es el uso de bioestimulantes o biopesticidas. Por un lado, los bioestimulantes son compuestos formulados en base a microorganismos PGP (Plant Growth Promotion) que poseen diferentes mecanismos de acción que inducen el crecimiento vegetal. Por otro lado, los biopesticidas son formulados en base a microorganismos que poseen actividad antagonista frente a algún fitopatógeno, ya sea porque lo combaten o porque previenen la infección. La mayoría de estos microorganismos con interés agronómico utilizados para estos fines provienen o bien de los suelos, ya que están relacionados con la fertilidad y la productividad del suelo; o bien del interior de los tejidos vegetales, pues son organismos capaces de establecer relaciones ás estrechas con las plantas que los microorganismos edáficos. En este sentido, tanto los microorganismos edáficos como los que habitan en el interior de las plantas, llamados endófitos, pueden tener un rol activo en el mantenimiento de los sistemas agrícolas. El estudio de estos microorganismos y de sus interacciones con las plantas puede abrir nuevas puertas al desarrollo de nuevos bioestimulantes o biopesticidas. Los microorganismos del suelo desempeñan funciones que son esenciales para el mantenimiento de los ecosistemas. Además, inducen el crecimiento de las plantas y mejoran la salud vegetal, por lo que son considerados como un importante recurso para el mantenimiento de la sostenibilidad en los sistemas agrícola. La interacción entre las plantas y los microorganismos del suelo no es unidireccional, ya que las plantas también influyen en la microbiota edáfica. En este sentido, diversos estudios apoyan la teoría de que las plantas reclutan a microorganismos específicos mediante la liberación de exudados, que las ayudan en la adquisición de nutrientes y la mitigación de estreses tanto bióticos como abióticos. Estos microorganismos pueden colonizar los tejidos de la planta y establecerse en su interior, pasando a ser considerados microorganismos endófitos, los cuales ahora conforman el microbioma de la planta. Este conjunto de microorganismos está involucrado en el mantenimiento del estado de la salud y la nutrición óptima de la planta. El origen de los microorganismos que interaccionan con las plantas es diverso. La mayoría son reclutados a partir del suelo circundante, y conforman la microbiota rizosférica de la planta, mientras que otros provienen del ambiente aéreo y tienen una influencia determinante sobre la microbiota filosférica, en la superficie de los tejidos vegetales. Tanto los microorganismos que conforman la rizosfera como los que conforman la filosfera pueden acabar colonizando el interior de las plantas y así establecerse en la endosfera. Para ello, deben de atravesar y de penetrar los tejidos vegetales. Las estimaciones indican que el suelo rizosférico es el contribuyente mayoritario de la microbiota endófita de las plantas,contribuyendo con más de dos tercios de la diversidad bacteriana y la fúngica. Además, la composición de los ambientes endofíticos es diversa, variando no solo entre las plantas sino también entre los compartimentos de un mismo individuo. Dado que estos microorganismos están intrínsecamente ligados a la planta, es probable que muchos de ellos posean mecanismos beneficiosos para las plantas. Sin embargo, muchas de estas funciones siguen sin estar caracterizadas. Las nuevas técnicas de secuenciación masiva evitan algunas de las limitaciones asociadas al cultivo de microorganismos ya que permiten analizar toda la comunidad, incluidas las células que están inactivas. Estos microorganismos pueden contar con diferentes mecanismos que sirvan para el desarrollo de bioestimulantes o biopesticidas. Por un lado, los bioestimulantes cuentan con mecanismos de promoción del crecimiento vegetal, que facilitan la adquisición de nutrientes como el nitrógeno, el fósforo, el potasio o el hierro o intervienen en la regulación hormonal de la planta. Por otro lado, los biopesticidas cuentan con mecanismos de protección frente a patógenos, como la producción de moléculas antibióticas o la inducción de la resistencia sistémica en la planta.

2024-01-01T00:00:00Z Peral Aranega, Ezequiel http://hdl.handle.net/10366/160328 2025-04-30T19:41:58Z 2024-01-01T00:00:00Z

[EN]World population is growing at an unprecedented rate, reaching 8 billion people in 2023 and projected to surpass 9 billion by 2050. This situation implies an increasing number of resources needed to meet humanity's demand for food and other necessities, intensifying human impacts on natural ecosystems. In this context, wheat and maize play a crucial role in human nutrition as they are two major crops worldwide, accounting for 28% of the global agricultural yield. However, current agricultural practices heavily rely on inorganic fertilizers and pesticides to achieve high yields. This causes significant environmental degradation. Inorganic fertilizers production is largely based on fossil fuels, contributing to greenhouse gas emissions and local acidification. Moreover, the overuse of these products degrades soil quality and leads to nutrient accumulation in freshwater systems, causing eutrophication. On the other side, phytopathogens, if not treated, are predicted to reduce cereal yield in around 32%, mostly because of fungi-caused diseases. Chemical pesticides are non-specific, persistent in the environment, and can lead to the development of resistances, reducing their effectiveness. This situation necessitates a paradigm shift in agriculture to address these issues, leading to the development of more sustainable practices. Bacterial inoculants based on plant-growth promoting bacteria (PGPB) can benefit plant development and provide protection against pests and diseases. PGPB action mechanisms enhance nutrient availability, stimulate plant growth, induce plant resistances to biotic and abiotic stresses, and provide protection against phytopathogens by competition and/or antagonism. PGPB based biostimulants have the potential to increase crop yields and quality without relying on chemical additives or, at least, reducing the dependence on them. Similarly, bacterial biocontrol agents (BBCA) based on PGPB can protect plants against phytopathogens meanwhile reducing the use of chemical pesticides. Recent studies revealed that insects might harbour more bacterial strains with strong antagonistic capacities against microbial pathogens than other niches, such as soil or plants. The Ips typographus bark beetle ecological context and previous studies suggest that bacterial associates to this beetle may have biocontrol potential against pathogenic fungi, representing an almost unexplored niche for obtaining strains with BBCA capacities. In this thesis, different laboratory, field, and computational techniques were used to search for bacterial inoculants of interest for wheat and maize plants, promoting their growth and protecting them against phytopathogens. The work has been divided in two sections: Section I includes the work carried out in the search for bacteria with biostimulant potential for durum wheat and common corn. Meanwhile, Section II focused on the search for BBCA of interest for forestry and crops management, with special interest in durum wheat, in a novel niche for BBCA, the Ips typographus bark beetle.

2024-01-01T00:00:00Z Ayuso Calles, Miguel http://hdl.handle.net/10366/159562 2025-09-03T11:26:58Z 2024-01-01T00:00:00Z

[ES] El objetivo general de la presente tesis doctoral es el desarrollo de bioinoculantes bacterianos multifuncionales, obtenidos mediante el aislamiento y la caracterización de bacterias rizosféricas y endófitas de especies vegetales, y el análisis funcional y molecular de su capacidad para mitigar los efectos dañinos del estrés salino y de mejorar las propiedades nutricionales de cultivos hortícolas de interés agroalimentario.

2024-01-01T00:00:00Z Torres Quezada, Isabel http://hdl.handle.net/10366/152623 2025-07-18T08:33:20Z 2022-01-01T00:00:00Z

[ES] El óxido nítrico es una molécula señalizadora con funciones importantes y variadas tanto en plantas como en hongos. En plantas, ha sido estudiado ampliamente en sus funciones de desarrollo, metabolismo y respuesta a enfermedades. Influye en los procesos de germinación, crecimiento radicular, respiración, cierre estomático y respuestas adaptativas a estreses bióticos y abióticos. En el caso de los hongos la biosíntesis y las funciones fisiológicas de esta molécula han sido estudiadas de forma muy limitada, aunque estudios recientes indican que el NO participa en numerosos procesos fisiológicos también en este grupo de organismos. En nuestro grupo de investigación trabajos anteriores han elucidado un rol del NO durante la germinación y desarrollo temprano. Además, también se ha detectado la presencia de NO en el nicho y se ha observado como las alteraciones en la homeostasis del NO afectan el desarrollo de la raíz primaria y proliferación de células meristemáticas. A su vez, se han detectado alteraciones en la biosíntesis, el transporte y señalización de auxinas en los mutantes de la homeostasis de NO. El NO también posee un amplio papel señalizador en hongos, participando en procesos que van desde la infección y colonización hasta la modulación del metabolismo secundario y desarrollo tanto sexual como asexual. Estudios previos han permitido caracterizar el sistema de detoxificación de NO en B. cinerea basado en la flavohemoglobina BCFHG1. Esta constituye el principal, y probablemente único, mecanismo detoxificador de NO en B. cinerea. Bcfhg1 se induce con la aplicación de NO exógeno y muestra un patrón de expresión in planta que podría conferir ventajas adaptativas a un patógeno necrótrofo durante el proceso de infección. Tomando en cuenta los trabajos antecedentes de esta tesis doctoral, cabe destacar que la sensibilidad de B. cinerea a NO exógeno parece depender estado de desarrollo, por lo que podría sugerirse que durante el establecimiento de una interacción entre B. cinerea y su huésped existe un flujo de NO al que pueden responder tanto la planta como el patógeno siendo, a su vez una estrategia de defensa de la planta y un medio del hongo para facilitar la infección. Esta tesis doctoral esta dividida en tres capítulos cuyo eje central es la implicación del NO en la interacción de B. cinerea con la planta huésped. En la misma se analizarán diferentes mutantes afectados en la homeostasis de NO en la planta modelo Arabidopsis thaliana. Se trabajará, además, con otras especies de interés agronómico como son Vitis vinífera y Phaseolus vulgaris. En el capítulo uno se presentan resultados relativos a la acción del NO respecto al metabolismo secundario con especial interés en los glucosinolatos. Los glucosinolatos son un grupo de metabolitos secundarios encontrados en 16 familias botánicas de plantas dicotiledóneas angiospermas y particularmente abundantes en la familia Brassicaceae, especialmente importantes en la defensa frente a insectos y patógenos. A pesar de la importancia del NO como molécula señalizadora, la cantidad de estudios sobre la presencia y función en las interacciones planta-patógeno es limitada y esta limitación en la literatura se hace más evidente si nos adentramos en la influencia del NO en la producción de metabolitos secundarios. En este trabajo, nuestro objetivo ha sido estudiar el papel del NO durante la interacción B. cinerea-A. thaliana con especial énfasis en el metabolismo secundario. Los resultados relativos a la producción de compuestos fenólicos y glucosinolatos, utilizando tanto mutantes de Arabidopsis como cepas de B. cinerea afectadas en la homeostasis del NO, serán presentados y discutidos con más detalle en este capítulo. El capítulo dos está enfocado en el análisis de la función de la/s nitrilasa/s en el hongo B. cinerea. Los nitrilos son compuestos orgánicos que contienen un grupo funcional (-CN) y suelen ser producidos como metabolitos de defensa de las plantas. Las nitrilasas catalizan la hidrólisis de estos compuestos a sus ácidos carboxílicos correspondientes. Puede que las nitrilasas formen parten de mecanismos que faciliten la colonización de las plantas y que tengan un rol en la síntesis hormonal, la utilización de nitrógeno y el catabolismo de glucosinolatos. B. cinerea posee 4 genes codificadores de nitrilasas (Bcin02g03010, Bcin14g00790, Bcin05g04960 and Bcin12g06180). De estos cuatro genes, previamente se ha comprobado que dos son altamente inducidos con la aplicación de NO exógeno. Esta inducción es mayor en los mutantes del gen BCFHG1, codificador de una flavohemoglobina, la cual constituye el método principal de detoxificación de NO que posee el hongo y le confiere protección frente a estrés nitrosativo. El capítulo estará centrado en el análisis funcional de la nitrilasa codificada por el gen Bcin12g06180, la cual presentaba la mayor inducción en dicho mutante con la aplicación de NO exógeno. Por último, tomando en cuenta la importancia de las enzimas nitrilasas en la degradación de los glucosinolatos y la influencia del NO sobre esta en el sistema de B. cinerea, decidimos analizar la actividad nitrilasa en Arabidopsis. Arabidopsis posee cuatro genes codificadores de nitrilasas (NIT1–NIT4), nombrados consecutivamente en el orden de su descubrimiento. Los mutantes de la homeostasis del NO de Arabidopsis podrían estar afectados en la degradación de glucosinolatos y/o sus productos de hidrólisis por lo que el objetivo de este capítulo es la evaluación de estas enzimas en un sistema afectado en la homeostasis de NO.

2022-01-01T00:00:00Z Manrique Gil, Isabel http://hdl.handle.net/10366/152608 2023-06-13T04:23:55Z 2022-01-01T00:00:00Z

[ES] La investigación se centra en la detección y señalización de óxido nítrico (NO) durante el desarrollo temprano de la planta y el estrés hipóxico en Arabidopsis thaliana.

2022-01-01T00:00:00Z Almendra Martín, Laura http://hdl.handle.net/10366/152503 2025-09-02T11:33:42Z 2022-01-01T00:00:00Z

[ES]La humedad del suelo (SM, soil moisture) es una variable clave en el ciclo hidrológico, fundamental para una gran diversidad de aplicaciones desde la de gestión de recursos hídricos y la productividad agrícola, hasta la predicción de la variabilidad climática. Considerada una variable climática esencial (ECV, essential climatic variable) por el GCOS (Global Climate Observing System), en las últimas décadas se ha puesto de manifiesto el interés creciente por disponer de bases de datos de SM de larga duración, continuas en el tiempo y el espacio. Además, el todavía incierto impacto del cambio climático en el ciclo hidrológico del planeta realza la necesidad de comprender y definir los cambios en la dinámica de la SM. Estos cambios son de particular interés en Europa, donde se prevé que el calentamiento global afecte negativamente a los recursos hídricos. Con ánimo de explorar diferentes métodos y enfoques de análisis para el estudio de la tendencia de cambio de la SM, su interacción con los patrones atmosféricos y la obtención de bases de datos apropiadas para el continente europeo, en esta tesis doctoral se han planteado tres objetivos específicos. En primer lugar, se destaca la necesidad de contar con bases de datos de SM continuas y de larga duración, tanto modelizadas como observacionales. Las misiones satelitales han facilitado esta labor enormemente, sin embargo, la continuidad de las series se ve comprometida debido a la existencia de lagunas en los datos, provocadas por diversos factores como la presencia de nieve o interferencias de radiofrecuencia que no hacen posible la medición. Motivado por esta necesidad, el primer objetivo de esta tesis doctoral busca comparar diferentes técnicas de gap-filling para estimar los valores ausentes en la base de datos de SM satelital más larga disponible en Europa, la proporcionada por la Climate Change Initiative (CCI). Para ello, se evaluaron diferentes técnicas, desde las más sencillas como interpolaciones lineales o cúbicas hasta técnicas más complejas como métodos autorregresivos (AR, autoregressive) o de aprendizaje automático (ML, machine learning) como las support vector machine (SVM) y los random forest (RF), donde se evaluó el uso de diferentes variables de entrada relacionadas con la dinámica de la SM. Todas estas técnicas fueron evaluadas tanto en el domino espacial como en el temporal. En segundo lugar, el impacto del cambio climático en la dinámica de la SM en Europa y la magnitud de estos cambios es todavía incierto. Por ello, se definió como segundo objetivo de esta tesis doctoral el estudio de las tendencias de la SM de los últimos 30 años en Europa utilizando diferentes tests estadísticos, escalas temporales (anual y mensual) y bases de datos. Los métodos utilizados fueron el test de Mann-Kendall (MK), ampliamente utilizado y basado en el comportamiento monótono, y el empirical mode decomposition (EMD), basado en una descomposición empírica de las series temporales. Además, se analizó la tendencia de los principales atributos que caracterizan la sequía agrícola (inicio, duración e intensidad). La significación estadística de las tendencias y sus signos fueron evaluados en los diferentes tipos de clima presentes en el continente europeo, según la clasificación de Köppen-Geiger. En tercer y último lugar, es sabido que la variabilidad de la SM está íntimamente ligada a los procesos atmosféricos. Sin embargo, muchos aspectos sobre las interacciones entre los sistemas suelo-atmósfera aún son inciertos. Aunque en Europa están bien definidas las teleconexiones atmosféricas, la relación de los diferentes patrones de circulación atmosférica con la SM no ha recibido especial atención. Además, rara vez se han analizado sus relaciones causales. En este contexto, se planteó como tercer y último objetivo de esta tesis doctoral el análisis de la influencia y las relaciones causales entre la North Atlantic Oscillation (NAO), la Arctic Oscillation (AO) y El Niño Southern Oscillation (ENSO) y la variabilidad de la SM en Europa. Para ello, se consideraron dos bases de datos de SM y se evaluaron, a una escala de tiempo mensual, la correlación y las relaciones causales entre los patrones atmosféricos y la SM. Los resultados obtenidos en esta tesis han permitido, por un lado, evaluar diferentes técnicas para el relleno de lagunas de datos de series satelitales de forma precisa. Los SVM aplicados al dominio espacial, utilizando la textura y las series de SM anteriores como inputs, han demostrado ser una buena herramienta para hacer frente a la limitación de las lagunas de datos presentes en las series satelitales. Por otro lado, haciendo uso de datos procedentes de la modelización se ha podido observar una tendencia general a condiciones más secas en el suelo en casi todo el continente europeo en los últimos 30 años, independientemente del tipo de clima, la escala temporal analizada o el método aplicado. También se ha encontrado un incremento de la intensidad y la duración de le periodos de sequía agrícola. Por último, los resultados de esta tesis han demostrado que existe una relación causal predominantemente negativa entre la NAO y AO, y la variabilidad de la SM en la mayor parte de Europa, sin apenas retraso temporal, mientras que con ENSO se observó una respuesta retardada de uno o dos meses en Europa central y noroeste. Los resultados obtenidos en esta tesis aportan nuevos conocimientos sobre los cambios que ha experimentado la SM en Europa y su interacción con los patrones atmosféricos, poniendo de manifiesto la importancia de la aplicación de metodologías avanzadas para llevar a cabo estos análisis, así como de obtener bases de datos apropiadas para los mismos.

2022-01-01T00:00:00Z Félix Ribeiro, Karoline Aparecida http://hdl.handle.net/10366/151020 2025-04-30T19:44:43Z 2018-01-01T00:00:00Z

[ES] El presente trabajo doctoral se inscribe en el ámbito de los estudios de Biología de Conservación, aplicados en concreto a varias especies vegetales consideradas de interés en el territorio geográfico de Castilla y León (catalogadas en las categorías de “En peligro de extinción (EN)” o “Vulnerable (VU)”, según el Decreto 63/2007, de 14 de junio, “por el que se crean el Catálogo de Flora Protegida de Castilla y León y la figura de protección denominada Microrreserva de Flora”). Las especies son: Astragalus devesae Talavera, A. González & G. López (Fabaceae, EN), Isatis platyloba Link ex Steud. (Brassicaceae, VU), Rhaponticum exaltatum (Cutanda ex Willk.) Greuter (Compositae, VU), Tephroseris coincyi (Rouy) Holub (Compositae, EN), Succisella microcephala (Willk.) G. Beck (Dipsacaceae, VU) y Veronica chamaepithyoides Lam. (Plantaginaceae, EN). Hemos aplicado distintas metodologías teórico-prácticas de esta rama del conocimiento con el objetivo de, por una parte, documentar aspectos relacionados con los requerimientos germinativos hasta el momento poco conocidos de estas especies, que además, en el caso de una de ellas nos han permitido obtener plántulas suficientes como para poder realizar un ensayo de reforzamiento poblacional. Por otra, generar modelos de nicho ecológico de esas mismas especies a tiempo presente y en escenarios futuros de cambio climático, utilizando los resultados obtenidos para diferentes fines, desde tratar de localizar nuevas poblaciones, a identificar lugares potencialmente idóneos para albergar nuevas poblacionales experimentales, o también, para evaluar la capacidad de las actuales áreas protegidas para mantener las poblaciones de estas especies en el futuro.

2018-01-01T00:00:00Z Plaza Martín, Javier http://hdl.handle.net/10366/150140 2025-07-18T08:35:29Z 2022-01-01T00:00:00Z

[ES]Las geotecnologías han emergido como la piedra angular del nuevo paradigma digital en el que están actualmente inmersas la agricultura y la ganadería contemporáneas, es decir, la nueva revolución agrícola, conocida como Agricultura 4.0, en la que se enmarcan las denominadas agricultura y ganadería de precisión. La obligada modernización a la que se ven sometidas las prácticas agroganaderas tradicionales viene desencadenada por el incipiente crecimiento demográfico y la consecuente demanda de productos agroalimentarios. Esta drástica transformación del mundo rural se torna imprescindible no solo para conseguir abastecer las necesidades de una población creciente, sino para rescatar a un sector primario cada vez más castigado por los elevados precios de los insumos y los escasos beneficios que se perciben. Como avales también de esta necesaria reconversión de los sistemas de manejo agropecuarios, entran también en juego pilares fundamentales de la productividad agrícola y ganadera como son la sostenibilidad medioambiental y el bienestar animal, ambos muy demandados en los productos de primera necesidad por una sociedad cada vez más concienciada con la producción respetuosa con el medio y con los animales. En este contexto, las geotecnologías no deben ser tomadas como herramientas que amenacen con sustituir los conocimientos agroganaderos tradicionales o que promuevan su desaparición. El enfoque es categóricamente opuesto, ya que tratan de perfeccionar la toma de decisiones de los agricultores y ganaderos, fundada en dicha sabiduría tradicional. Esta complementariedad resultará en nuevos modelos de gestión de los sistemas agropecuarios, que serán ostensiblemente más respetuosos con el medio que los sustenta, a la par que se maximizará el respeto hacia los principios básicos de sostenibilidad y bienestar animal. Por lo tanto, en este trabajo se plantea la siguiente hipótesis: la implementación de nuevas estrategias metodológicas basadas en geotecnologías en el sector agroganadero contribuirán a reducir los costes de producción, el tiempo empleado por agricultores y ganaderos en sus labores y el impacto medioambiental que dichas labores pudieran ocasionar, generando beneficios de corte económico, social y medioambiental. Considerando la hipótesis anteriormente expuesta, el objetivo de la presente tesis doctoral se centró en demostrar el potencial de las geotecnologías como herramientas alternativas y complementarias destinadas a la mejora de la gestión de los sistemas de manejo agroganaderos en el ámbito económico, medioambiental y desde el punto de vista del bienestar animal. Así mismo, se planteó que dichas estrategias geotecnológicas sirvan también para ahondar en el aprendizaje de nuevos conocimientos agrícolas y ganaderos. Para lograr este objetivo, se plantearon una serie de aportaciones que permitieran dilucidar la idoneidad de dichas geotecnologías en la gestión agroganadera.

2022-01-01T00:00:00Z Saati Santamaría, Zaki http://hdl.handle.net/10366/149429 2025-09-03T11:59:46Z 2021-01-01T00:00:00Z

[ES] Los microorganismos habitan los distintos ecosistemas de la naturaleza, incluyendo plantas y animales. Para ello, deben haber evolucionado y haberse adaptado a cada una de las condiciones ambientales del lugar en el que viven. Los microorganismos juegan un papel muy importante en cada nicho, influyendo en los ciclos biogeoquímicos y, en el caso de hospedadores pluricelulares, participando en su nutrición y defensa, entre otros roles. Por lo tanto, el estudio de la ecología y funciones de los microorganismos puede ayudar a explicar la vasta complejidad de la naturaleza. Además, este conocimiento puede ser de ayuda para el desarrollo y aplicación en industria, biotecnología y clínica de nuevos procesos microbianos. Las Pseudomonas constituyen uno de los géneros procariotas más diversos y adaptables. Su versatilidad metabólica les permite sobrevivir en ambientes muy distintos. Se han identificado Pseudomonas en seres humanos, plantas, suelos, ríos, profundidades marinas, ambientes psicrófilos, insectos y en muchos otros nichos u hospedadores. Esta diversidad de ambientes en los que las bacterias del género Pseudomonas evolucionan ha dado lugar a una amplia diversificación de sus miembros, de manera que se erigen como uno de los géneros bacterianos más diversos. Esta alta diversidad, junto con su versatilidad y su facilidad de ser cultivadas en condiciones de laboratorio, da lugar a un descubrimiento constante de nuevas especies bacterianas pertenecientes a este género. En esta tesis se han llevado a cabo distintas aproximaciones para descifrar nuevas funciones y aspectos ecológicos del género Pseudomonas. [EN] Microbes live in almost all the different ecosystems in nature, including plants and animals. For that, they must have evolved and adapted to each of the different environmental conditions where they appear. In each niche, microbes play very important roles, such as in biogeochemical cycles and, in case of pluricellular hosts, in host nourishment and defense, amongst others. Thus, the study of the ecology and functions of microbes may help to explain the complexity of nature. Also, this knowledge may be helpful for the development and application of new microbial processes for industrial, biotechnological and clinical purposes. Pseudomonas bacteria constitute one of the most diverse and adaptable prokaryotic genera. Their metabolic versatility allows them to survive in many different environments. Members of Pseudomonas have been identified in human beings, plants, soils, rivers, deep seas, psychrophilic environments, insects and other environmental niches or hosts. The diversity of environments where Pseudomonas bacteria evolve and diversify has led to a broad evolution of its members, thus being one of the most diverse bacterial genera. This high diversity of the genus plus its versatility and easy growth in laboratory conditions results in a continuous discovery of new species classified within the genus. In this thesis, different approaches have been carried out in order to decipher novel functionalities and ecological aspects of the genus Pseudomonas.

2021-01-01T00:00:00Z