Análisis del metabolismo, las funciones, la ecología y la taxonomía del género Pseudomonas

Abstract

[ES] Los microorganismos habitan los distintos ecosistemas de la naturaleza, incluyendo plantas y animales. Para ello, deben haber evolucionado y haberse adaptado a cada una de las condiciones ambientales del lugar en el que viven. Los microorganismos juegan un papel muy importante en cada nicho, influyendo en los ciclos biogeoquímicos y, en el caso de hospedadores pluricelulares, participando en su nutrición y defensa, entre otros roles. Por lo tanto, el estudio de la ecología y funciones de los microorganismos puede ayudar a explicar la vasta complejidad de la naturaleza. Además, este conocimiento puede ser de ayuda para el desarrollo y aplicación en industria, biotecnología y clínica de nuevos procesos microbianos. Las Pseudomonas constituyen uno de los géneros procariotas más diversos y adaptables. Su versatilidad metabólica les permite sobrevivir en ambientes muy distintos. Se han identificado Pseudomonas en seres humanos, plantas, suelos, ríos, profundidades marinas, ambientes psicrófilos, insectos y en muchos otros nichos u hospedadores. Esta diversidad de ambientes en los que las bacterias del género Pseudomonas evolucionan ha dado lugar a una amplia diversificación de sus miembros, de manera que se erigen como uno de los géneros bacterianos más diversos. Esta alta diversidad, junto con su versatilidad y su facilidad de ser cultivadas en condiciones de laboratorio, da lugar a un descubrimiento constante de nuevas especies bacterianas pertenecientes a este género. En esta tesis se han llevado a cabo distintas aproximaciones para descifrar nuevas funciones y aspectos ecológicos del género Pseudomonas.

[EN] Microbes live in almost all the different ecosystems in nature, including plants and animals. For that, they must have evolved and adapted to each of the different environmental conditions where they appear. In each niche, microbes play very important roles, such as in biogeochemical cycles and, in case of pluricellular hosts, in host nourishment and defense, amongst others. Thus, the study of the ecology and functions of microbes may help to explain the complexity of nature. Also, this knowledge may be helpful for the development and application of new microbial processes for industrial, biotechnological and clinical purposes. Pseudomonas bacteria constitute one of the most diverse and adaptable prokaryotic genera. Their metabolic versatility allows them to survive in many different environments. Members of Pseudomonas have been identified in human beings, plants, soils, rivers, deep seas, psychrophilic environments, insects and other environmental niches or hosts. The diversity of environments where Pseudomonas bacteria evolve and diversify has led to a broad evolution of its members, thus being one of the most diverse bacterial genera. This high diversity of the genus plus its versatility and easy growth in laboratory conditions results in a continuous discovery of new species classified within the genus. In this thesis, different approaches have been carried out in order to decipher novel functionalities and ecological aspects of the genus Pseudomonas.