Perfiles de interacción Químico-Genómicos en Saccharomyces cerevisiae: respuesta a agentes estresantes

Abstract

[ES] El objetivo general del trabajo recogido en esta memoria es identificar los procesos celulares involucrados en la respuesta al estrés celular provocado por compuestos que inducen estrés a distintos niveles en la célula, caracterizar funcionalmente los genes involucrados en mecanismos de sensibilidad/resistencia frente a estos compuestos, y tratar de determinar el mecanismo de acción de los mismos. La aproximación empleada, que a continuación desarrollaremos en mayor detalle, ha consistido en realizar un análisis fenotípico cuantitativo de la respuesta a estrés celular ejercido por dichos compuestos en la colección completa de mutantes de deleción de la levadura Saccharomyces cerevisiae, generando así perfiles químico‐genómicos de sensibilidad y resistencia de cada uno de los agentes empleados. Los objetivos específicos que nos planteamos son: 1) Determinar los mecanismos de sensibilidad/resistencia a los distintos compuestos. 2) Identificar redes funcionales y rutas redundantes afectadas por los agentes estresantes. 3) Identificar dianas secundarias y determinar posibles efectos secundarios. 4) Elucidar la función de ORFs sin caracterizar. 5) Comparar el efecto, a nivel biológico, de cada uno de los compuestos. 6) Comparar los cambios inducidos por los compuestos en los perfiles de expresión génica con los efectos fenotípicos producidos por los mismos.

[EN] The overall objective of the work contained in this report is to identify the cellular processes involved in the response to cellular stress caused by stress-inducing compounds at different levels in the cell, functionally characterize genes involved in mechanisms of sensitivity / resistance to these compounds, and try to determine the mechanism of their action. The approach used, which then develop in more detail, has been to make a quantitative phenotypic analysis of the response to cellular stress exerted by these compounds in the entire collection of deletion mutants of the yeast Saccharomyces cerevisiae, thus generating chemical genomic profiles sensitivity and resistance of each of the agents employed. The specific objectives that we consider are: 1) determine the mechanisms of sensitivity / resistance to various compounds. 2) to identify functional networks and redundant paths affected by the stressors. 3) Identify secondary targets and identify possible side effects. 4) To elucidate the function of uncharacterized ORFs. 5) Compare the effect on the biological level, each of the compounds. 6) Compare the compounds induced changes in gene expression profiles with the phenotypic effects produced by the same.