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<title>CIC. Tesis del Centro de Investigación del Cáncer</title>
<link>http://hdl.handle.net/10366/4585</link>
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<pubDate>Fri, 01 May 2026 15:10:37 GMT</pubDate>
<dc:date>2026-05-01T15:10:37Z</dc:date>
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<title>Papel de la señalización RAS–PI3K en la regulación del fenotipo y la función de los fibroblastos asociados a cáncer</title>
<link>http://hdl.handle.net/10366/171141</link>
<description>[ES] El cáncer de pulmón (CP) continúa siendo una de las principales causas de mortalidad por cáncer a nivel mundial. A pesar de los importantes avances terapéuticos logrados en los últimos años, el pronóstico de los pacientes sigue siendo desfavorable, en gran medida debido a la elevada heterogeneidad tumoral, al diagnóstico tardío y a la rápida aparición de resistencias terapéuticas. Aunque las terapias dirigidas a la célula tumoral han demostrado eficacia clínica, su beneficio a largo plazo suele ser limitado, lo que subraya la necesidad de explorar estrategias complementarias que aborden otros componentes del microambiente tumoral. En este contexto, los fibroblastos asociados a cáncer (CAFs) han emergido como reguladores clave de la progresión tumoral y de la respuesta a tratamiento.&#13;
En esta tesis doctoral se investigó si la modulación del fenotipo y la función de los CAFs mediante la disrupción de la interacción RAS–PI3K podría constituir una estrategia eficaz para limitar la progresión del CP. Los estudios realizados in vitro demostraron que la pérdida de la señalización RAS–PI3K en fibroblastos indujo una reprogramación profunda de su identidad funcional, promoviendo un estado menos protumoral caracterizado por una disminución de la contractilidad, una menor capacidad de remodelación de la matriz extracelular (MEC) y alteraciones marcadas en la organización del colágeno. Estos cambios se asociaron a la atenuación del programa transcripcional miofibroblástico y a un desplazamiento del fenotipo CAF hacia un estado más inmunomodulador.&#13;
Desde el punto de vista mecanístico, se identificó a YAP como un efector relevante de la señalización RAS–PI3K en los CAFs. No obstante, la recuperación parcial del programa miofibroblástico tras su reintroducción indicó que YAP, aunque contribuyó de forma&#13;
significativa, no fue suficiente por sí solo para restaurar completamente este fenotipo, lo que sugirió la existencia de mecanismos adicionales dependientes de la señalización RAS–PI3K. De manera coherente, las alteraciones en la composición y organización de la MEC derivadas de la disrupción de RAS–PI3K influyeron directamente en el comportamiento de las células tumorales, modulando procesos de plasticidad celular, como la transición epitelio–mesénquima (EMT), y reduciendo su capacidad proliferativa.&#13;
Estos efectos protectores se validaron in vivo mediante un modelo murino con disrupción específica del eje RAS–PI3K en fibroblastos. De forma notable, la pérdida de esta interacción en el compartimento estromal fue suficiente para reducir el crecimiento tumoral y reconfigurar el microambiente tumoral, incluyendo cambios en la composición del sistema inmune. Además, la combinación de esta alteración estromal con tratamientos convencionales o terapias dirigidas potenció el efecto antitumoral, lo que respalda el potencial de estrategias terapéuticas combinadas.&#13;
En conjunto, este trabajo identifica el eje RAS–PI3K–YAP como un regulador central de la plasticidad y función de los CAFs y demuestra que su modulación permite reprogramar el microambiente tumoral hacia un estado menos permisivo para la progresión del cáncer. Estos hallazgos proporcionan una base conceptual sólida para el desarrollo de nuevas aproximaciones terapéuticas dirigidas al estroma en el CP.; [EN] Lung cancer remains one of the leading causes of cancer-related mortality worldwide. Despite major therapeutic advances in recent years, patient prognosis remains poor, largely due to tumour heterogeneity, late diagnosis, and the rapid emergence of therapeutic resistance. While tumour cell–targeted therapies have shown clinical benefit, their long-term efficacy is frequently limited, highlighting the need to explore complementary strategies that target nonmalignant components of the tumour microenvironment. In this context, cancer-associated fibroblasts (CAFs) have emerged as key regulators of tumour progression and treatment response.&#13;
This doctoral thesis investigated whether modulation of CAF phenotype and function through disruption of the RAS–PI3K interaction could represent a viable strategy to restrain lung tumour progression. In vitro analyses demonstrated that loss of RAS–PI3K signalling in fibroblasts induced a profound reprogramming of their functional identity, promoting a less protumoural state characterised by reduced contractility, impaired extracellular matrix (ECM) remodelling, and marked alterations in collagen organisation. These changes were accompanied by attenuation of the myofibroblastic transcriptional programme and a shift towards an immunomodulatory CAF phenotype.&#13;
Mechanistically, YAP was identified as an important downstream effector of RAS–PI3K signalling in CAFs. However, the partial restoration of myofibroblastic features following YAP reintroduction indicated that YAP alone was insufficient to fully re-establish the myofibroblastic state, suggesting the involvement of additional RAS–PI3K-dependent regulatory mechanisms. Consistent with these findings, alterations in ECM composition and organisation resulting from RAS–PI3K disruption directly impacted tumour cell behaviour, modulating cellular plasticity, including epithelial–mesenchymal transition (EMT), and limiting proliferative capacity.&#13;
These protective effects were validated in vivo using a murine model with fibroblast-specific disruption of the RAS–PI3K axis. Notably, loss of RAS–PI3K signalling in the stromal compartment was sufficient to reduce tumour growth and to remodel the tumour microenvironment, including changes in immune cell composition. Moreover, combining stromal RAS–PI3K disruption with conventional chemotherapy or targeted therapies enhanced antitumour efficacy, supporting the potential of combinatorial therapeutic approaches.&#13;
In conclusion, this work identifies the RAS–PI3K–YAP axis as a central regulator of CAF plasticity and function and demonstrates that its modulation enables reprogramming of the tumour microenvironment towards a state less permissive to cancer progression. These findings provide a strong conceptual framework for the development of novel stroma-targeted therapeutic strategies in lung cancer.
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<pubDate>Fri, 13 Mar 2026 00:00:00 GMT</pubDate>
<guid isPermaLink="false">http://hdl.handle.net/10366/171141</guid>
<dc:date>2026-03-13T00:00:00Z</dc:date>
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<title>Non-redundant roles of SOS1 and SOS2 RAS-GEFS in systemic metabolism, hepatocellular carcinoma, and intestinal integrity</title>
<link>http://hdl.handle.net/10366/170440</link>
<description>[ES] sta tesis examina los roles no redundantes de SOS1 y SOS2 en diversos contextos fisiológicos y patológicos. En particular, analiza sus funciones en la biología del tejido adiposo, en el carcinoma hepatocelular (HCC) inducido por dietilnitrosamina (DEN) e inyección hidrodinámica por vena caudal (HTVI), en la respuesta a la inhibición farmacológica de SOS1 (BI-3406) y en la regeneración del epitelio intestinal. Al integrar estos distintos modelos, el trabajo resalta cómo SOS1 y SOS2 moldean de manera diferente el metabolismo, la homeostasis tisular y la progresión de la enfermedad.&#13;
A nivel del tejido adiposo, SOS1 y SOS2 son esenciales para mantener la integridad del tejido y el equilibrio energético. La pérdida conjunta provoca lipoatrofia grave, colapso metabólico y muerte. SOS1 es fundamental para estadios tardíos de la diferenciación de los adipocitos, la acumulación de lípidos, la señalización de la insulina y el equilibrio redox, mientras que SOS2 cumple un papel modulador o compensatorio. Juntas, aseguran la regulación de la temperatura, el uso de glucosa y la estabilidad metabólica del cuerpo.&#13;
Dentro del ámbito hepático, SOS1 actúa como un impulsor clave de la iniciación y progresión del HCC al promover el crecimiento tumoral, la reprogramación metabólica y la señalización proliferativa. Su eliminación genética reduce significativamente la carga tumoral y mejora la supervivencia, mientras que el bloqueo farmacológico con BI-3406 suprime el crecimiento tumoral y la actividad de ERK, mostrando además efectos aditivos con sorafenib, lo que lo convierte en un objetivo terapéutico prometedor. En contraste, SOS2 limita las actividades oncogénicas impulsadas por SOS1. La pérdida de SOS2 aumenta el metabolismo lipídico, la inflamación y la señalización proliferativa, agravando así la progresión tumoral. Por lo tanto, SOS1 sostiene principalmente los programas oncogénicos y metabólicos, mientras que SOS2 actúa como un freno regulador.&#13;
Respecto al intestino delgado, ambas proteínas son necesarias para la proliferación epitelial, el mantenimiento de las células madre y la integridad de la barrera intestinal. Su ausencia conjunta deteriora la función de las criptas, aumenta la permeabilidad intestinal y conduce a una inflamación sistémica que deriva en sepsis. Intervenciones metabólicas o antioxidantes no ayudan, pero estrategias regenerativas con organoides o factores de crecimiento logran restaurar la barrera y mejorar la supervivencia.&#13;
En conjunto, SOS1 y SOS2 son clave para mantener el tejido adiposo y la integridad intestinal, lo que permite mantener el equilibrio metabólico del organismo. En HCC, SOS1 impulsa la tumorogénesis, la proliferación hepática y la adaptación metabólica, mientras que SOS2 regula el metabolismo de los lípidos, la inflamación y las respuestas al estrés. Juntas, garantizan la homeostasis sistémica, y su disfunción provoca alteraciones metabólicas, tumorales e intestinales graves.; [EN] This thesis investigates the non-redundant roles of SOS1 and SOS2 across various physiological and pathological contexts. Specifically, it examines their functions in adipose tissue biology, hepatocellular carcinoma (HCC) driven by diethylnitrosamine (DEN) and hydrodynamic tail vein injection (HTVI), responses to pharmacological SOS1 inhibition (BI-3406), and intestinal epithelial regeneration. By integrating these diverse models, the work highlights how SOS1 and SOS2 differentially shape metabolism, tissue homeostasis, and disease progression.&#13;
In adipose tissue, SOS1 and SOS2 are indispensable for maintaining tissue integrity and systemic energy balance. Combined loss results in severe lipoatrophy, metabolic collapse, and lethality. Mechanistically, SOS1 is required for late adipocyte differentiation, lipid accumulation, insulin signaling, and redox balance, whereas SOS2 provides modulatory or compensatory input. Together, they regulate thermoregulation, glucose utilization, and whole-body metabolic homeostasis.&#13;
Within the hepatic context, SOS1 acts as a key driver of HCC initiation and progression by promoting tumor growth, metabolic rewiring, and proliferative signaling. Its genetic deletion significantly reduces tumor burden and improves survival, while pharmacological inhibition with BI-3406 suppresses tumor growth and ERK activity and shows additive effects with sorafenib, making it a promising therapeutic target. SOS2, by contrast, restrains SOS1-driven oncogenic outputs. Its loss enhances lipid metabolism, inflammation, and proliferative signaling, thereby aggravating tumor progression. Thus, SOS1 primarily sustains oncogenic and metabolic programs, while SOS2 functions as a regulatory brake.&#13;
Regarding the small intestine, both SOS1 and SOS2 are required for epithelial proliferation, stem cell maintenance, and barrier integrity. Their combined loss compromises the crypt function, increases permeability, and triggers systemic inflammation, leading to sepsis. Neither metabolic nor antioxidant interventions were effective, whereas regenerative strategies (orthotopic organoid delivery or growth-factor supplementation) partially restored barrier function and improved survival.&#13;
Overall, SOS1 and SOS2 are indispensable for preserving adipose tissue and intestinal integrity, ensuring proper metabolic balance and systemic stability. In the context of HCC, these regulatory functions extend to liver physiology, where SOS1 primarily drives tumorigenesis, hepatocyte proliferation, and metabolic adaptation, while SOS2 modulates lipid metabolism, inflammatory signaling, and stress responses. Together, they safeguard systemic homeostasis, and their dysfunction results in severe metabolic, oncogenic, and intestinal disorders
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<pubDate>Wed, 01 Jan 2025 00:00:00 GMT</pubDate>
<guid isPermaLink="false">http://hdl.handle.net/10366/170440</guid>
<dc:date>2025-01-01T00:00:00Z</dc:date>
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<title>Chromatin remodeling and epitranscriptomic regulation of the DNA damage response and immune function in nervous system disorders</title>
<link>http://hdl.handle.net/10366/170303</link>
<description>[ES] Las enfermedades neurológicas y el glioblastoma (GBM) son trastornos graves del&#13;
sistema nervioso y constituyen una causa importante de discapacidad y mortalidad. Los&#13;
mecanismos que subyacen a estas alteraciones y la patogénesis del GBM siguen siendo poco&#13;
comprendidos. En consecuencia, no existen terapias efectivas y la supervivencia es muy baja.&#13;
Profundizar en su conocimiento e identificar nuevas estrategias terapéuticas resulta esencial.&#13;
En este contexto, dilucidar cómo la remodelación de la cromatina y las modificaciones de ARN&#13;
regulan la respuesta al daño en el ADN (DDR) y el sistema inmune pueden aportar nuevas&#13;
perspectivas sobre los procesos neurodegenerativos y oncológicos del sistema nervioso.&#13;
La primera parte del estudio analizó los defectos moleculares y funcionales causados&#13;
por variantes patogénicas raras en vaccinia-related kinase 1 (VRK1), una quinasa nuclear&#13;
mutada en pacientes con trastornos neurológicos. Nos centramos en las variantes L200P y&#13;
R387H, identificadas en un paciente con neuropatía motora de inicio temprano y signos&#13;
piramidales. Los defectos en la DDR pueden contribuir a estas patologías, ya que las neuronas&#13;
son especialmente sensibles al daño genómico. Además, se han descrito alteraciones en la&#13;
remodelación de la cromatina en pacientes con enfermedades similares. Nuestros resultados&#13;
mostraron que las variantes alteraron la estabilidad y la actividad quinasa de VRK1, causando&#13;
defectos en la señalización temprana de la DDR y un aumento de marcas de histonas&#13;
represivas, que pueden reducir la accesibilidad de la cromatina e inducir represión génica.&#13;
La segunda parte tuvo como objetivo dilucidar el papel de los reguladores epigenéticos&#13;
y epitranscriptómicos en GBM. La resistencia a temozolomida (TMZ), el tratamiento estándar,&#13;
y el microambiente tumoral (TME) inmunosupresor son los principales obstáculos para una&#13;
terapia eficaz. En este contexto, la quinasa VRK1 y la ARNt metiltransferasa METTL1 surgieron&#13;
como posibles dianas terapéuticas que actúan mediante mecanismos complementarios:&#13;
remodelación de la cromatina y regulación post-transcripcional. La inhibición de VRK1 redujo&#13;
las marcas activadoras de histonas y aumentó las represivas, promoviendo probablemente la&#13;
compactación de la cromatina e influyendo en la iniciación de la DDR. METTL1 se encontró&#13;
sobreexpresada en GBM y asociada con peor pronóstico. Mediante modelos in vitro e in vivo,&#13;
demostramos que la pérdida de METTL1 redujo la proliferación, incrementó la sensibilidad a&#13;
TMZ, por la acumulación de daño génico, y desplazó el TME hacia estados más antitumorales,&#13;
limitando la progresión tumoral. El mecanismo molecular subyacente probablemente implica&#13;
una reprogramación de la traducción debido a la pérdida de la modificación N7-&#13;
metilguanosina (m7G) en los ARNt. En conjunto, la inhibición de VRK1 o METTL1 representa&#13;
una estrategia terapéutica prometedora para el GBM.; [EN] Neurological diseases and glioblastoma (GBM) are major conditions of the nervous&#13;
system and main causes of disability and mortality worldwide. The mechanisms underlying&#13;
neurological disorders and GBM pathogenesis remain poorly understood. Consequently,&#13;
eJective therapies are lacking, and patient survival remains very poor. Therefore, there is an&#13;
urgent need to better understand these conditions and identify new therapeutic approaches.&#13;
In this context, elucidating how chromatin remodeling and RNA modifications regulate the&#13;
DNA damage response (DDR) and immune function may provide insights into both&#13;
neurodegenerative and oncogenic processes within the nervous system.&#13;
The first part of the study investigated the molecular and functional defects caused by&#13;
rare pathogenic variants in vaccinia-related kinase 1 (VRK1), a nuclear kinase found mutated&#13;
in patients with neurological disorders. We especially focused on the L200P and R387H&#13;
variants, recently identified in a patient with juvenile-onset motor neuropathy presenting with&#13;
pyramidal signs. Defects in the DDR can contribute to neurological diseases, as neurons are&#13;
particularly sensitive to the accumulation of DNA damage. Moreover, alterations in chromatin&#13;
remodeling have been reported in patients with these diseases. We demonstrated that these&#13;
two variants altered VRK1 stability and reduced kinase activity, leading to defective early DDR&#13;
signaling, and increased accumulation of repressive histone marks, which may promote&#13;
reduced chromatin accessibility and gene repression.&#13;
The second part of this study aimed to elucidate the role of epigenetics and&#13;
epitranscriptomic regulators in GBM. Resistance to temozolomide (TMZ), the current standard&#13;
therapy, and the highly immunosuppressive tumor microenvironment (TME) constitute major&#13;
challenges to eJective treatment. In this context, the kinase VRK1 and the tRNA&#13;
methyltransferase METTL1) emerged as potential therapeutic targets acting through&#13;
complementary mechanisms, chromatin remodeling and post-transcriptional regulation. Our&#13;
results showed that VRK1 inhibition reduced activating histone marks and increased&#13;
repressive ones, likely promoting chromatin compaction, and influencing the initiation of the&#13;
DDR. On the other hand, METTL1 was found to be overexpressed in GBM and associated with&#13;
poor prognosis. Using in vitro and in vivo models, we demonstrated that METTL1 loss reduced&#13;
cell proliferation, enhanced sensitivity to TMZ through DNA damage accumulation, and shifted&#13;
the TME toward a more antitumoral state, thereby limiting tumor progression. The underlying&#13;
molecular mechanism likely involves translation reprogramming due to the absence of the N7-&#13;
methylguanosine (m7G) modification in tRNAs. Altogether, inhibition of VRK1 or METTL1 may&#13;
represent promising new therapeutic approaches for GBM.
</description>
<pubDate>Wed, 01 Jan 2025 00:00:00 GMT</pubDate>
<guid isPermaLink="false">http://hdl.handle.net/10366/170303</guid>
<dc:date>2025-01-01T00:00:00Z</dc:date>
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<title>Functional Analysis of PCNA Deubiquitylation in Replication Fork Dynamics and Okazaki Fragment Maturation in Saccharomyces cerevisiae</title>
<link>http://hdl.handle.net/10366/167325</link>
<description>[ES] PCNA (Antígeno nuclear de células en proliferación) es una proteína esencial, altamente conservada a lo largo de la evolución, desde bacterias hasta mamíferos. Esta molécula, que actúa abrazando al ADN, orquesta numerosos procesos relacionados con la replicación y reparación del genoma. PCNA sirve como plataforma sobre la que se unen distintas proteínas para realizar sus funciones sobre el ADN, como por ejemplo las ADN polimerasas Pol ε y Pol δ. Uno de los mecanismos moleculares que permite a PCNA dirigir qué proteínas o rutas señalizadoras deben actuar es su modificación postraduccional (PTM). Particularmente relevante para este trabajo es la modificación de PCNA mediante la adición de subunidades de ubiquitina. Tradicionalmente, esta PTM ocurre cuando las polimerasas Pol ε y Pol δ se bloquean porque su centro catalítico no se puede adaptar a una lesión en el ADN. Para evitar el colapso del proceso replicativo, PCNA se ubiquitina, activando así las denominadas rutas de tolerancia al daño en el ADN (DDT, del inglés DNA Damage Tolerance). Estas vías permiten atravesar las lesiones y continuar la replicación. Sin embargo, dado que estas rutas conllevan ciertos riesgos para la integridad genómica, deben estar estrictamente reguladas. La forma de desactivarlas es mediante la eliminación de las marcas de ubiquitina en PCNA por acción de desubiquitinasas. En Saccharomyces cerevisiae, el organismo modelo de este estudio, antes de comenzar este trabajo se conocían dos desubiquitinasas de PCNA (PCNA-DUBs): Ubp10 y Ubp12. Estas proteasas colaboran regulando las rutas DDT de forma asimétrica en las dos hebras del ADN, las cuales, además, se replican mediante mecanismos distintos. La hebra líder se replica de manera continua, mientras que la hebra rezagada lo hace de forma discontinua, mediante la síntesis de millones de fragmentos cortos conocidos como Fragmentos de Okazaki, que posteriormente se procesan y unen para formar una hebra continua en un proceso denominado maduración de fragmentos de Okazaki (OFM).&#13;
En este trabajo partimos de la identificación de una nueva PCNA-DUB, Ubp1. Aunque esta proteína se había descrito exclusivamente como citoplasmática, aquí identificamos una subpoblación nuclear que participa en la desubiquitinación de PCNA. Colaborando con las ya conocidas Ubp10 y Ubp12, Ubp1 contribuye a evitar la acumulación de PCNA ubiquitinado durante la replicación del ADN. La eliminación combinada de estas tres proteínas provoca la acumulación crónica de PCNA ubiquitinado incluso en condiciones no perturbadas, es decir, en ausencia de daño exógeno al ADN. En este contexto, establecemos una relación causa-efecto entre dicha acumulación crónica y un proceso replicativo lento e ineficiente. Además, demostramos que, bajo condiciones de estrés replicativo, cuanto mayor es el defecto en la desubiquitinación de PCNA debido a la ausencia de las PCNA-DUBs, mayor es la acumulación de estructuras replicativas asociadas a las rutas de tolerancia al daño, determinando una correlación directa entre ambos fenómenos.Por otro lado, este trabajo también explora el posible papel de la desubiquitinación de PCNA en la replicación de la hebra rezagada, concretamente durante la maduración de los fragmentos de Okazaki (OFM). En este contexto, demostramos que Ubp10 participa directamente en dicho proceso a través de su actividad desubiquitinadora sobre PCNA. La ausencia de Ubp10 provoca un defecto en este proceso, lo que conduce a una acumulación patológica de PCNA en la cromatina. Esta retención anómala constituye la causa última de una maduración incorrecta de los fragmentos de Okazaki, impidiendo que sean ligados en el tiempo adecuado. Determinamos que estos defectos derivados de la pérdida de Ubp10 son completamente suprimidos mediante el uso de alelos inestables de PCNA, que favorecen su descarga espontánea de la cromatina. Finalmente, concluimos que esta OFM defectiva, consecuencia directa de la falta de Ubp10, en última instancia provoca un defecto replicativo a lo largo de todo el genoma, que se manifiesta como una duplicación del ADN lenta e ineficiente.; [EN] PCNA (Proliferating Cell Nuclear Antigen) is an essential protein highly conserved throughout evolution, from bacteria to mammals. PCNA acts as a sliding clamp that encircles DNA, coordinating numerous processes involved in DNA replication and repair. It functions as a platform that recruits and organizes numerous protein partners, such as DNA polymerases Pol ε and Pol δ, to carry out their functions on the genome. One of the key molecular mechanisms through which PCNA directs protein recruitment and pathway choice is its post-translational modification (PTM). Particularly relevant to this work is the ubiquitylation of PCNA, which typically occurs when DNA polymerases are stalled due to DNA lesions that block their catalytic activity. In response, PCNA becomes ubiquitylated, triggering the DNA damage tolerance (DDT) pathways, allowing replication to bypass DNA lesions. However, because these pathways carry inherent risks for genomic instability, they must be tightly regulated. Their timely inactivation depends on the removal of ubiquitin moieties from PCNA by specific deubiquitylating enzymes. In Saccharomyces cerevisiae, the model organism used in this study, two PCNA-specific deubiquitylases (PCNA-DUBs) have been characterized to date: Ubp10 and Ubp12. These two PCNA-DUBs regulate DDT asymmetrically on the two DNA strands, which are replicated through distinct mechanisms. While the leading strand is synthesized continuously, the lagging strand is replicated discontinuously through the synthesis of millions of short DNA segments known as Okazaki fragments. These are later processed and ligated into a continuous strand during the Okazaki Fragment Maturation (OFM) process.&#13;
In this work, we identify and characterize a novel PCNA-DUB, Ubp1. Previously reported as an exclusively cytoplasmic protein, we now demonstrate the existence of a nuclear subpopulation of Ubp1 that participates in PCNA deubiquitylation. Collaborating with Ubp10 and Ubp12, Ubp1 contributes to the prevention of PCNA ubiquitylation accumulation during DNA replication. Combined deletion of these three PCNA-DUBs leads to chronic accumulation of PCNA-K164 ubiquitylation even under unperturbed conditions, in the absence of exogenous DNA damage. We establish a direct causal link between this persistent ubiquitylation and delayed defective DNA replication. Moreover, we demonstrate that under replication stress, the greater the defect in PCNA deubiquitylation due to the absence of PCNA-DUBs, the higher the accumulation of replication intermediates associated with DNA damage tolerance pathways, revealing a direct correlation between them. Furthermore, this study also explores a role for PCNA deubiquitylation in lagging-strand replication, specifically during OFM. We show that Ubp10 directly participates in this process through its PCNA deubiquitylation activity. Loss of Ubp10 results in defective deubiquitylation, leading to pathological retention of PCNA on chromatin. This unscheduled retention disrupts timely OFM, preventing proper ligation of Okazaki fragments. We demonstrate that defects arising from Ubp10 loss are fully suppressed by disassembly-prone PCNA mutants, which promote spontaneous PCNA unloading from chromatin. Ultimately, we conclude that defective OFM due to Ubp10 depletion leads to a genome-wide replication defect, manifested as slow and inefficient DNA synthesis.
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<pubDate>Wed, 01 Jan 2025 00:00:00 GMT</pubDate>
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<dc:date>2025-01-01T00:00:00Z</dc:date>
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<title>Caracterización funcional de genes de la región 16p13.12-p13.11 implicada en cáncer colorrectal de inicio temprano</title>
<link>http://hdl.handle.net/10366/167167</link>
<description>[ES] El cáncer colorrectal (CCR) constituye uno de los principales problemas de salud a nivel global, siendo el tercer&#13;
tumor más frecuente y la segunda causa de muerte por cáncer. Aunque la incidencia del CCR ha aumentado en las últimas décadas, se ha logrado reducir la mortalidad gracias a la mayor implementación de programas de cribado, y al desarrollo de tratamientos más eficaces. No obstante, es preocupante el rápido aumento del CCR en menores de 50 años, conocido como cáncer colorrectal de inicio temprano (EOCRC), que ya supone alrededor del 10% del total de los casos diagnosticados. Este incremento se atribuye en parte a cambios en el estilo de vida y afecta predominantemente a pacientes sin antecedentes familiares ni base genética conocida, dificultando su detección temprana. Al no estar incluidos en los programas de cribado, estos pacientes suelen ser diagnosticados en fases avanzadas, con tumores más agresivos y peor pronóstico, lo que ha contribuido a un aumento de la mortalidad en este grupo.&#13;
&#13;
En estudios previos, el grupo identificó una deleción recurrente que afecta al gen NOMO1, proponiendo su posible&#13;
papel como supresor tumoral. Sin embargo, los análisis funcionales descartaron su papel como gen driver. Sin&#13;
embargo, la existencia de otros dos genes NOMO (NOMO1 y NOMO3) que presentan una alta homología con&#13;
NOMO1 pueden apuntar a un mecanismo de compensación por parte de estos genes. En este trabajo, se confirmó mediante FISH la existencia de un único gen NOMO, descartando la existencia de tres genes NOMO distintos como indicaban algunas bases de datos. Además, se exploraron otras funciones del gen NOMO, como su papel estructural en el retículo endoplásmico (RE), ya descrito en otras líneas celulares. No obstante, ni la microscopía electrónica ni los ensayos de inmunofluorescencia revelaron cambios en la morfología del RE ni alteraciones en los lisosomas tras la pérdida de NOMO en la línea HCT-116.&#13;
&#13;
Posteriormente, se amplió el análisis a los genes PDXDC1 y MRTFB, también localizados en 16p13.12. En muestras tumorales de EOCRC, PDXDC1 se encontró delecionado en hasta un 33% de los casos en homocigosis. Se generaron modelos KO mediante CRISPR/Cas9 en la línea celular HCT-116 para ambos genes. En ambos casos, la deleción no afectó a la proliferación, apoptosis ni ciclo celular, pero sí aumentó significativamente la capacidad migratoria de las células, lo que sugiere un papel potencial en etapas tempranas del proceso metastásico.&#13;
&#13;
Se generaron además modelos dobles y triples KO (NOMO/PDXDC1, NOMO/MRTFB, y NOMO/PDXDC1/&#13;
MRTFB), en los que no se observaron cambios adicionales relevantes en viabilidad, ciclo celular o apoptosis, pero se observó un fenotipo de mayor migración. Esto sugiere que estos genes podrían actuar sobre rutas comunes&#13;
reguladoras de la migración, y que la pérdida de uno solo es suficiente para inducir el fenotipo.&#13;
&#13;
A nivel transcriptómico, a través de análisis mediante RNA-seq, se observó la desregulación de rutas vinculadas a la remodelación de la matriz extracelular, tráfico vesicular y procesamiento de proteínas, coherentes con los fenotipos observados. También se detectó infraexpresión de genes mitocondriales y relacionados con la síntesis proteica, indicando una posible reprogramación metabólica, característica de las células tumorales. Además, se validaron los datos de RNA-seq mediante RT-qPCR. Aunque no todos los cambios observados transcriptómicamente fueron confirmados, estos ensayos refuerzan la importancia de validar mediante técnicas complementarias los resultados de análisis ómicos.&#13;
&#13;
Finalmente, se evaluó la respuesta a fármacos antitumorales (paclitaxel, cloroquina y panobinostat), sin encontrar&#13;
diferencias sistemáticas atribuibles a la pérdida de los genes analizados. La combinación CQ+LBH mostró un efecto sinérgico sobre la apoptosis, consistente con estudios previos del grupo&#13;
&#13;
En conjunto, los datos obtenidos apoyan que la deleción de estos genes de la región 16p13.12-p13.11, más que&#13;
inducir el inicio de la carcinogénesis colorrectal, podría promover un fenotipo pro-migratorio e invasivo,&#13;
contribuyendo así a la agresividad observada en los tumores EOCRC.
</description>
<pubDate>Wed, 01 Jan 2025 00:00:00 GMT</pubDate>
<guid isPermaLink="false">http://hdl.handle.net/10366/167167</guid>
<dc:date>2025-01-01T00:00:00Z</dc:date>
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<title>Unraveling the role of RNA modifications in immune evasion and tumor progression in prostate cancer</title>
<link>http://hdl.handle.net/10366/166506</link>
<description>[EN] Prostate cancer (PCa) is the most prevalent cancer in men worldwide. Although it initially responds well to androgen deprivation therapy, it frequently progresses to a lethal, castration-resistant stage characterized by poor immune infiltration and therapy resistance. Although transcriptional and epigenetic mechanisms underlying PCa progression have been extensively studied, the contribution of RNA modifications to tumor evolution and immune remodeling remains poorly understood. In this thesis, we addressed this knowledge gap through two complementary projects focused on the role of RNA-modifying enzymes in shaping the tumor microenvironment.&#13;
The first part of this study investigated the function of METTL1, a tRNA methyltransferase, in regulating immune responses in prostate cancer. Using in vitro and in vivo models, we demonstrated that loss of METTL1 activates interferon signaling via STAT1, promoting a pro-inflammatory tumor milieu characterized by increased M1 macrophages and CD8+ T cell infiltration. METTL1 depletion also enhanced the efficacy of immune checkpoint blockade therapies in preclinical models, positioning METTL1 as a promising target to sensitize otherwise immunologically "cold" prostate tumors.&#13;
The second part employed single-cell transcriptomics and multiplex immunofluorescence to characterize epithelial–immune crosstalk during PCa progression. We identified castration-resistant epithelial subpopulations with proliferative and stem-like features, including cells enriched for the RNA methyltransferase Pcif1. Pcif1+ epithelial cells exhibited transcriptional programs linked to immune modulation, tissue remodeling, and spatial proximity to regulatory T cells and exhausted CD8+ T cells. Furthermore, Pcif1+ cells selectively engaged in immunosuppressive ligand–receptor interactions with myeloid and lymphoid compartments, contributing to the establishment of a tumor-permissive niche.&#13;
Together, these findings reveal RNA modifications as critical regulators of tumor–immune interactions in prostate cancer. By modulating cytokine profiles, immune cell recruitment, and cell-cell communication, RNA-modifying enzymes such as METTL1 and PCIF1 play pivotal roles in promoting tumor progression and immune evasion. Targeting these pathways, either through direct inhibition of RNA modifiers or by disrupting specific epithelial–immune interactions, may offer novel therapeutic strategies to improve immunotherapy responses in prostate cancer.&#13;
&#13;
[ES] El cáncer de próstata (CaP) es el más prevalente en hombres a nivel mundial. Aunque inicialmente responde bien a la terapia de privación androgénica, frecuentemente progresa hacia un estadio resistente a la castración y letal, caracterizado por escasa infiltración inmune y resistencia terapéutica. Aunque los mecanismos transcripcionales y epigenéticos en la progresión del CaP han sido ampliamente estudiados, el papel de las modificaciones de ARN en la evolución tumoral y la remodelación inmune sigue siendo poco conocido. En esta tesis, abordamos esta cuestión mediante dos proyectos complementarios centrados en el papel de las enzimas modificadoras de ARN en la configuración del microambiente tumoral.&#13;
La primera parte de este estudio analiza la función de METTL1, una metiltransferasa de ARN de transferencia, en la regulación de respuestas inmunes en el CaP. Usando modelos in vitro e in vivo, demostramos que su pérdida activa la señalización de interferón a través de STAT1, promoviendo un entorno tumoral proinflamatorio caracterizado por un aumento de macrófagos M1 y linfocitos T CD8+. Además, la depleción de METTL1 mejoró la eficacia de la inmunoterapia en modelos preclínicos, posicionándola como una diana prometedora para sensibilizar tumores de próstata inmunológicamente "fríos".&#13;
La segunda parte empleó transcriptómica de célula única e inmunofluorescencia multiplexada para caracterizar la interacción epitelio-inmunidad durante la progresión del CaP. Identificamos subpoblaciones epiteliales resistentes a la castración con características proliferativas y de tipo célula madre, incluyendo células enriquecidas en Pcif1. Estas células exhibieron programas asociados a modulación inmune, remodelación tisular y proximidad a células T reguladoras y T CD8+ exhaustas. Además, establecieron interacciones ligando-receptor inmunosupresoras específicas con las poblaciones mieloides y linfoides, contribuyendo a un nicho tumoral permisivo.&#13;
En conjunto, estos hallazgos revelan que las modificaciones de ARN son reguladores clave de las interacciones tumor–inmunidad en el CaP. Al modular perfiles de citocinas, reclutamiento de células inmunes y comunicación celular, las enzimas como METTL1 y PCIF1 desempeñan un papel crucial en la progresión tumoral y la evasión inmune. El bloqueo de estas vías, ya sea mediante inhibición directa de modificadores de ARN o mediante la disrupción de interacciones epitelio–inmunidad específicas, podría ofrecer nuevas estrategias terapéuticas para mejorar la respuesta inmunoterapéutica en el CaP.
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<pubDate>Wed, 01 Jan 2025 00:00:00 GMT</pubDate>
<guid isPermaLink="false">http://hdl.handle.net/10366/166506</guid>
<dc:date>2025-01-01T00:00:00Z</dc:date>
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<title>Caracterización funcional de variantes de significado incierto en genes reparadores del ADN</title>
<link>http://hdl.handle.net/10366/163929</link>
<description>[ES]El cáncer es un conjunto de enfermedades genéticas caracterizadas por el crecimiento celular descontrolado, con más de 100 tipos identificados.  Los riesgos para desarrollar cáncer se clasifican en factores modificables (como el consumo de alcohol y tabaco) y no modificables. El estudio examina el metabolismo de las células cancerosas y su capacidad para evadir el sistema inmunitario.  Se destaca la importancia de los síndromes hereditarios asociados a mutaciones en los genes BRCA1 y BRCA2, que son relevantes en la reparación del ADN y en la prevención del cáncer
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<pubDate>Wed, 01 Jan 2025 00:00:00 GMT</pubDate>
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<dc:date>2025-01-01T00:00:00Z</dc:date>
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<title>Evaluación Sistemática de la Respuesta Humoral en COVID-19 y Leucemia Linfocítica Crónica mediante Proteómica Funcional</title>
<link>http://hdl.handle.net/10366/163717</link>
<description>[ES]En múltiples enfermedades, tanto en episodios agudos como en su cronificación, se ha observado una disfunción de la respuesta inmune (tanto a nivel celular como humoral). Entre estas patologías se encuentran COVID-19 y Leucemia Linfocítica Crónica (LLC). En ambos casos, se ha descrito cómo la disfunción de la respuesta inmune está relacionada con la dinámica de la respuesta humoral que, a su vez, se asocia con la evolución y el progreso de la enfermedad. En este sentido, diversos mecanismos pueden determinar la disfunción de la respuesta inmune como (1.) el reconocimiento, procesamiento y presentación antigénica, (2.) la regulación de la señalización intracelular, (3.) el microambiente celular mediante inmunosupresión y/o agotamiento celular. En su conjunto, se produce una disfunción de&#13;
la respuesta humoral asociada a una progresión más rápida y agresiva de estas patologías.&#13;
La caracterización de estos mecanismos subyacentes es una fuente muy valiosa para la determinación de biomarcadores de utilidad en el diagnóstico, pronóstico y evolución de la enfermedad. Asimismo, estos biomarcadores de disfunción inmune pueden tener potencial relevancia en la estratificación y el tratamiento de los pacientes. En esta Tesis Doctoral, se ha realizado una caracterización sistemática de la respuesta humoral mediante metodologías avanzadas de Proteómica Clínica (basadas en&#13;
microarrays y en espectrometría de masas). Se han estudiado perfiles inflamatorios (mediante un panel de reactantes de fase aguda), presencia de autoanticuerpos, perfiles serológicos (IgM e IgG) frente a microorganismos más prevalentes y perfiles proteómicos diferenciales de células B para evaluar la señalización intracelular. Todo ello, permite evaluar las alteraciones en la respuesta humoral tanto en pacientes con COVID-19 como en pacientes con LLC, en distintos estadios de la enfermedad. Los&#13;
resultados describen perfiles proteicos significativamente diferenciales de acuerdo a la gravedad y a la evolución en ambas enfermedades. En resumen, la caracterización proteómica, sistemática y exhaustiva de la respuesta humoral ha permitido establecer un panel de potenciales biomarcadores proteicos de&#13;
interés tanto para el diagnóstico y pronóstico como para la estratificación de grupos de pacientes y su seguimiento clínico.
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<pubDate>Sun, 01 Dec 2024 00:00:00 GMT</pubDate>
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<dc:date>2024-12-01T00:00:00Z</dc:date>
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<title>VAV1 inhibition: exploring drug design strategies for targeting gef activity</title>
<link>http://hdl.handle.net/10366/163651</link>
<description>[EN]VAV1 is a RHO guanine nucleotide exchange factor (GEF) predominantly expressed in hematopoietic cells, where it activates RHO GTPases —primarily RAC1—and plays essential roles in T cell development, immune response and cell signaling. Recent studies have elucidated VAV1’s involvement in various immune system pathologies and cancers, underscoring its therapeutic potential. Understanding the structure-activity relationship of VAV1 concerning its GEF-dependent and GEF-independent functions provides a foundation for developing specific VAV1 GEF inhibitors. In this thesis, we employed different&#13;
drug design strategies to identify specific inhibitors of VAV1 GEF activity. We identified two pockets of interest within key regulatory domains of the protein that enabled to perform a virtual ligand screening of millions of compounds. From the hits obtained in this screening, we created a library of compounds designed based on two promising hits, introducing chemical modifications to improve initial VAV1 GEF inhibition. The activity of these compounds, asserted through VAV1—RAC1 nucleotide exchange assays, showed significant improvement following various chemical modifications. Further characterization&#13;
of lead compounds was performed using biochemical and cellular assays to assess their specificity for VAV1 GEF inhibition. Additional strategies in this project included the design and synthesis of a stapled peptide targeting VAV1, as well as high-throughput screening of two large compound libraries. Overall, this thesis presents a comprehensive exploration of strategies for identifying and validating VAV1 GEF inhibitors, revealing promising candidates for further investigation
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<pubDate>Sun, 01 Dec 2024 00:00:00 GMT</pubDate>
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<dc:date>2024-12-01T00:00:00Z</dc:date>
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<title>Exploration and development of bioinformatics methods for survival analysis and drug targeting in cancer</title>
<link>http://hdl.handle.net/10366/163622</link>
<description>[ES]Esta tesis doctoral ha desarrollado y aplicado con éxito múltiples técnicas y algoritmos bioinformáticos para abordar y resolver desafíos específicos en la gestión, análisis e interpretación de datos ómicos complejos derivados de muestras humanas de cáncer. El trabajo se ha centrado en dos tipos principales de cáncer: el cáncer de mama (BRCA) y el cáncer colorrectal (CRC). Los datos ómicos se han integrado y analizado junto con información clínica relevante, principalmente datos de supervivencia y progresión de la enfermedad, así como otros parámetros clave como el estadio del tumor, el grado y la respuesta al tratamiento. El trabajo también aborda el campo de la farmacogenómica, explorando las correlaciones entre los fármacos antitumorales (como compuestos químicos pequeños) y la activación de genes&#13;
humanos. Como comentario general final, este trabajo ha demostrado el potencial de integrar enfoques estadísticos avanzados y bioinformáticos con grandes conjuntos de datos de cáncer. Con ello hemos conseguido mejorar tanto el análisis de supervivencia como la identificación de dianas terapéuticas, con el objetivo final de optimizar la aplicación combinada de datos ómicos y clínicos para una mejor  caracterización de los resultados de los pacientes con cáncer. Los métodos desarrollados no solo&#13;
proporcionan herramientas valiosas para la investigación del cáncer, sino que también sientan una base sólida para futuras aplicaciones en el campo de la medicina personalizada.
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<pubDate>Sun, 01 Dec 2024 00:00:00 GMT</pubDate>
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<dc:date>2024-12-01T00:00:00Z</dc:date>
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<title>Enzalutamida y receptor de andrógenos en el cáncer de mama</title>
<link>http://hdl.handle.net/10366/163571</link>
<description>[ES]La reutilización de fármacos, también conocida como "drug repurposing", es una estrategia que identifica nuevos usos de medicamentos aprobados para tratar condiciones diferentes a las de su propósito original. Ofrece un enfoque más simplificado&#13;
para el desarrollo de nuevos tratamientos, ya que los medicamentos reutilizados han pasado por pruebas rigurosas de seguridad y eficacia. En este contexto, la enzalutamida, un medicamento desarrollado inicialmente para el tratamiento del cáncer de próstata, ha surgido como un candidato para la terapia del cáncer de mama. Estudios recientes han demostrado que la enzalutamida muestra una eficacia comparable tanto en líneas celulares de TNBC como en líneas no TNBC,&#13;
aunque su efectividad dependía de la presencia de AR227. Es importante destacar que solo un subconjunto de pacientes con TNBC tiene tumores que expresan AR, lo que sugiere que los inhibidores de AR podrían ser especialmente beneficiosos para este&#13;
subgrupo. Un ensayo clínico de fase II (NCT01889238) evaluó la eficacia y seguridad de la enzalutamida en pacientes con TNBC localmente avanzado o metastático con más del 10% de expresión de AR en las células tumorales. Los pacientes del estudio fueron administrados con 160 mg enzalutamida una vez al día hasta la progresión de la enfermedad. La evaluación de la respuesta se realizó cada 8 semanas durante los primeros 12 meses y luego cada 12 semanas mediante métodos radiológicos estándar. Figura 18. Variantes de splicing de AR. El exón 1 codifica el NTD, los exones 2 y 3 codifican el DBD, el exón 4 codifica la región bisagra o hinge y los exones 5, 6, 7 y 8 codifican el LBD y CTD. AR-V567es es una variante de splicing que carece de los exones 5-7 con un codón de parada en el exón 8. AR-V7 contiene los exones 1-3, lo que lleva a la adición de un nuevo exón críptico 3. Los pacientes que suspendieron el tratamiento por razones ajenas a la progresión de la enfermedad continuaron con evaluaciones de imágenes hasta confirmar la progresión. De los 118 pacientes inscritos, 78 fueron evaluables. La tasa de beneficio clínico a las 16 semanas fue del 33% en el subgrupo evaluable. La mediana de supervivencia libre de progresión fue de 3.3 meses en el subgrupo evaluable. La mediana de supervivencia global fue de 17,6 meses en el subgrupo evaluable. Por tanto, el estudio informó de una actividad clínica prometedora y un perfil de seguridad favorable para la enzalutamida en&#13;
pacientes con TNBC AR+ avanzado. Los eventos adversos observados fueron consistentes con el perfil de seguridad conocido de la enzalutamida, lo que subraya la necesidad de seguir explorando este medicamento como una opción de tratamiento&#13;
para el cáncer de mama. Posteriormente, la enzalutamida se ha combinado con varias terapias en el tratamiento del cáncer de mama AR+, mejorando la eficacia del tratamiento. Se han evaluado combinaciones con quimioterapia, como paclitaxel228, así como con terapias dirigidas, como inhibidores de PI3K y CDK4/6 como palbociclib229 o ribociclib230 en tumores TNBC. También se ha probado junto con terapias endocrinas, como exemestano y fulvestrant231–233, en pacientes con tumores ER+ y con inhibidores de HER2, como trastuzumab234.
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<pubDate>Sun, 01 Dec 2024 00:00:00 GMT</pubDate>
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<dc:date>2024-12-01T00:00:00Z</dc:date>
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<title>Papel tumorogénico de la vía de transducción de señales MEK5/ERK5</title>
<link>http://hdl.handle.net/10366/161233</link>
<description>[SPA] Señalización celular se define como el proceso en el que las células interactúan con su entorno respondiendo a los diferentes estímulos que reciben del exterior generando respuestas frente a estos. Su descubrimiento se remonta al año 1855 de la mano de Claude Bernard cuando describió cómo las secreciones de glándulas carentes de ductos se liberaban al torrente sanguíneo y parecían ejercer cierto efecto sobre células distantes [1]. Esta recepción y respuesta a estímulos por parte de las células se da gracias a moléculas que se encuentran en la membrana celular y a complejas redes de señalización internas que conectan generalmente receptores de membrana con diversos sustratos intracelulares. De entre las vías de señalización más estudiadas en humanos destacan la vía de PI3K/Akt (phosphatidylinositol 3-kinase/protein kinase B (AKT)) y las vías de&#13;
MAPKs (Mitogen-Activated Protein Kinase). En esta sección nos enfocaremos en las vías de MAPK
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<pubDate>Mon, 01 Jan 2024 00:00:00 GMT</pubDate>
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<dc:date>2024-01-01T00:00:00Z</dc:date>
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<title>Molecular and func-onal analysis of Cdc14 and PP4 phosphatases in response to DNA damage.</title>
<link>http://hdl.handle.net/10366/161178</link>
<description>[ENG]Cells are constantly exposed to different endogenous and exogenous agents that can produce lesions in the gene7c material. Within all the types of DNA damage, double-strand breaks are the most damaging type of injury to the cell. In response to this damage, cells have developed a set of processes collec7vely known as the DNA Damage Response (DDR). One of the ini7al steps in homologous recombina7on (HR) is DNA-end resec7on. It involves the degrada7on of one DNA strand on both sides of the DSB in the 5'-3’ sense, genera7ng single-stranded DNA (ssDNA). Subsequently, different proteins bind to this ssDNA forming a&#13;
protofilament capable of searching for homology and invading the template strand. While many proteins involved in these processes are regulated through phosphoryla7on by protein kinases, litle is known about the role of protein phosphatases in these mechanisms. The role of cyclin-dependent kinase (CDK) in regula7ng numerous mechanisms in response to DNA damage has been extensively studied. Since Cdc14 is the only known phosphatase that antagonizes Cdk, it is reasonable to think that its func7on is also crucial in regula7ng these processes. Thus, the absence of Cdc14 ac7vity lead s to excessive resec7on&#13;
and genomic instability, sugges7ng a potencial role for the phosphatase in nega7vely regula7ng this process to temporally restrain resec7on progression and ensure an accurate DNA repair via homologous recombina7on. Addi7onally, high-throughput sequencing analyses have allowed for the inves7ga7on of various aspects of DNA repair at the nucleo7de level, including the extent of resec7on, its direc7onality, and the gene conversion events generated during lesion repair. Interes7ngly, the removal of Dna2 ac7vity or the disrup7on of its Cdk phosphoryla7on sites prevents the over-resec7on phenotype observed in the absence of the phosphatase, sugges7ng that Cdc14 nega7vely regulates resec7on by controlling the Sgs1/Dna2 complex. Curiously, only the mito7cally ac7vated Cdc14 (FEAR and MEN), but not DNA damage-dependent Cdc14 ac7va7on, dephopshorylates Dna2.&#13;
Addi7onally, the dissolu7on of Dna2 foci, as observed by fluorescence microscopy, occurs exclusively during mitosis, sugges7ng that only mito7c ac7va7on of Cdc14 inhibits resec7on. In summary, these results demonstrate that the Cdk/Cdc14 module func7ons as a molecular switch that acts on the exonuclease Dna2 to regulate the proper extension of singlestranded DNA ends generated during resec7on, ensuring the accurate restora7on of the DNA molecule.
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<pubDate>Fri, 01 Nov 2024 00:00:00 GMT</pubDate>
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<dc:date>2024-11-01T00:00:00Z</dc:date>
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<title>New mechanisms of contractile protein non-muscle myosin II regulation: role of microtubules and tropomyosins in the control of cell contractility.</title>
<link>http://hdl.handle.net/10366/161100</link>
<description>[SPA]La generación de fuerzas mecánicas es un proceso fundamental en biología, controlando procesos biológicos como la homeostasis y la morfogénesis de tejidos, la migración y división celular. El citoesqueleto es una red intracelular dinámica y&#13;
adaptativa que comprende tres sistemas principales: microfilamentos, microtúbulos y filamentos intermedios. Cada uno de estos sistemas posee propiedades mecánicas y funciones específicas. En conjunto, estos sistemas facilitan la ejecución de procesos&#13;
celulares dinámicos al proporcionar estructura, soporte, organización y generación de fuerzas. Mientras que las fuerzas necesarias para la segregación cromosómica durante la mitosis provienen de dineínas y quinesinas, las miosinas de clase II producen fuerzas asociadas a los filamentos de actina. Las miosinas de clase II se unen a la actina y generan contracción a través de la hidrólisis de ATP, formando polímeros que ejercen  fuerzas mediante el movimiento coordinado de los filamentos de actina. La miosina II no muscular (NMII) tiene tres parálogos: NMII-A, NMII-B y NMII-C. Estos parálogos tienen funciones comunes y específicas en la polarización, migración y división celular. Este trabajo tiene dos partes. Primero, examinamos la regulación cruzada de los microtúbulos y actomiosina cuando los primeros son inhibidos con paclitaxel, un agente quimioterapéutico que impide la división celular y que sigue en uso clínico a pesar de la aparición frecuente de resistencia. En este trabajo, demostramos que el paclitaxel produce contracción dependiente de la actina a través de su acción sobre la miosina II. En la segunda parte, abordamos los roles específicos de los parálogos de la miosina II en la adhesión y migración celular, y revelamos roles  specíficos de los parálogos en su regulación recíproca, así como una función inesperada del entrecruzamiento de actina no contráctil mediado por tropomiosinas en la dinámica de adhesión
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<pubDate>Fri, 01 Nov 2024 00:00:00 GMT</pubDate>
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<dc:date>2024-11-01T00:00:00Z</dc:date>
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<title>Impact of C3G on hematopoiesis after myeloablation: effects on hematopoietic precursors and megakaryocyte niche function.</title>
<link>http://hdl.handle.net/10366/161095</link>
<description>[ES]La hematopoyesis es el proceso por el cual se generan todos los componentes celulares de la sangre. Este proceso se da de forma activa durante toda la vida y, en adultos,  se lleva a cabo en la médula ósea (BM, por sus siglas en inglés), donde una limitada población de células, conocidas como células madre hematopoyéticas (HSC), con capacidad de autorrenovación y diferenciación es capaz de generar los distintos progenitores restringidos que darán finalmente lugar a las poblaciones celulares maduras de la sangre. Las células madre y progenitoras hematopoyéticas (HSPC) permanecen en un estado quiescente, pero pueden ser activadas en respuesta a diversos factores de estrés tales como infección, ablación de la BM, o trasplante. Por ello, un adecuado balance entre la capacidad de autorrenovación y diferenciación de las HSC ha de ser estrictamente regulado para evitar que las reservas de HSPC se agoten o proliferen en exceso, lo que podría dar lugar a la aparición de enfermedades mieloproliferativas o leucemias. En esta regulación participa el microentorno específico de las HSPC, conocido como “nicho”. Este se compone de diferentes tipos celulares: megacariocitos (MK), adipocitos (BMA), células del tejido óseo, macrófagos, células perivasculares, células endoteliales y células madre mesenquimales. Todas estas poblaciones son capaces de modular la quiescencia, migración y diferenciación de las HSC, bien a través de interacciones directas célula-célula o mediante la secreción de multitud de factores...En conclusión, este trabajo demuestra el papel de C3G en la determinación del destino celular en diferentes niveles dentro de la jerarquía hematopoyética, promoviendo la diferenciación hacia el linaje mieloide. Además, la participación de C3G en la vía de TPO/c-Mpl, con implicaciones en MPN y otras enfermedades hematológicas, convierte a&#13;
C3G en una potencial diana terapéutica y/o en un marcador pronóstico de tumores hematopoyéticos.
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<pubDate>Fri, 18 Oct 2024 00:00:00 GMT</pubDate>
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<dc:date>2024-10-18T00:00:00Z</dc:date>
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<title>Análisis multiparamétrico de las MSC en pacientes con SMD de bajo riesgo: implicaciones fisiopatológicas y terapéuticas</title>
<link>http://hdl.handle.net/10366/160409</link>
<description>[ES] La heterogeneidad clínico-pronóstica de los SMD, asociada a su compleja fisiopatología, hace que sea necesario profundizar en la caracterización exhaustiva de la enfermedad y sus subtipos. Se avanza en la idea de intentar engranar cada mutación (o grupo de mutaciones) con un subtipo clínico y pronóstico específico de SMD que permita un mejor conocimiento de la enfermedad y conseguir así un tratamiento más dirigido.&#13;
Los SMD sin SA ni del(5q) (categorías SMD-DM/DU de la OMS 2017) engloban a un conjunto frecuente y relativamente homogéneo de pacientes de bajo riesgo, que no poseen características fenotípicas ni citogenéticas que los identifiquen. El manejo de sus citopenias tampoco es satisfactorio dado que sus opciones terapéuticas son limitadas. Su pronóstico es favorable, por lo que la supervivencia de los pacientes estará condicionada por una peor calidad de vida debida a la no corrección de los síntomas relacionados con las citopenias, fundamentalmente la anemia. Por ello es necesario ahondar en su conocimiento y herramientas de tratamiento. El uso de MSC sanas podría tener interés en estos pacientes al haber demostrado ya su capacidad terapéutica en distintos ámbitos, especialmente en el contexto de mejoría de las citopenias. Su perfil de seguridad parece también favorable para estos pacientes que tienen generalmente edad avanzada, comorbilidades y no son candidatos a medidas que deterioren o empeoren estas condiciones.&#13;
La hipótesis de trabajo del presente estudio consiste en que la administración de MSC de donante sano en pacientes con SMD-DM/DU podría ayudar a mejorar la función hematopoyética y reducir las citopenias en estos pacientes, potenciando la hematopoyesis sana residual. Como paso previo al desarrollo de un potencial ensayo clínico para explorar esta hipótesis, es necesario profundizar en el conocimiento de las MSC de estos pacientes y analizar las interacciones entre las MSC sanas y la función hematopoyética in vitro en los SMD, que constituyen el objeto de la presente tesis doctoral.
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<pubDate>Mon, 01 Jan 2024 00:00:00 GMT</pubDate>
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<dc:date>2024-01-01T00:00:00Z</dc:date>
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