INNOVA Salamanca empezó en 1998 cuando un grupo de jóvenes investigadores de la Universidad de Salamanca se asoció para intentar mejorar su situación laboral a corto y largo plazo. En el año 2000, INNOVA Salamanca pasó a formar parte de la Federación de Jóvenes Investigadores (FJI-Precarios), colaborando en la mejora de la situación de los mismos a nivel estatal. A nivel local, INNOVA Salamanca colabora con los Vicerrectorados de Estudiantes y de Investigación en la redacción de las bases de los programas propios de la Universidad de Salamanca (predoctorales y postdoctorales). INNOVA Salamanca también organiza y colabora en actividades relacionadas la carrera investigadora.