Análisis del transcriptoma del foco epileptogénico en el modelo de epilepsia GASH/Sal

Abstract

[ES]Introducción. El hámster GASH/Sal es un modelo de epilepsia audiógena de origen genético cuyo foco epileptogénico es el colículo inferior (CI). Objetivos. Analizar el transcriptoma del CI buscando obtener un perfil de los genes relevantes en el GASH/Sal que podría usarse para buscar un vínculo común con la epilepsia humana. Metodología. Hemos realizado un estudio de RNA-Seq provenientes del CI de hámsteres controles y GASH/Sal sometidos a estimulación auditiva, alineándolo con los genomas de referencia del hámster chino (Cricetus griseus) y dorado (Mesocricetus auratus) respectivamente, mediante la plataforma Illumina 75bp Single-End. Se selecionaron los genes que tuvieron una tasa de cambio (log Fold-Change) mayor a 1.5, estadísticamente significativa. Los genes diferencialmente expresados, se validaron por PCR cuantitativa. Resultados. Se observaron 41 genes diferencialmente expresados en la referencia del genoma Mesocricetus auratus y 32 en la de Cricetulus griseus, siendo doce genes similares en ambos análisis (Atp2a3, C6, Egr1, Egr2, Egr3, Fos, Fosb, Junb, Npas4, Rxfp2, Slc28a1 and Ttr). Adicionalmente, los genes diferencialmente expresados están relacionados con procesos biológicos de señalización, metabolismo y transporte, apareciendo disminuidos en el núcleo epileptógeno del GASH/Sal en comparación con el mismo núcleo del hámster control. Conclusiones. Los resultados revelan cambios moleculares en el colículo inferior del GASH/Sal que puede servir como punto de partida para buscar los mecanismos epileptogénicos en este modelo animal y posible correlaciones con la epilepsia humana.