Variaciones en el número de copias como responsables de enfermedad en población pediátrica

Abstract

[ES]Introducción. La hibridación genómica comparada por arrays (aCGH) es una técnica de citogenética molecular que durante estos últimos años ha cobrado gran importancia debido a su gran rentabilidad diagnóstica en pacientes con un cuadro clínico de retraso global del desarrollo/discapacidad intelectual (RGD/DI), malformaciones congénitas o trastornos del espectro autista (TEA), todas ellas entidades clínicas altamente prevalentes y que suponen un grave problema sanitario y social. Objetivos. Analizar las peticiones y resultados de los CGH arrays solicitados en la Unidad de Referencia Regional de Diagnóstico Avanzado de Enfermedades Raras de Castilla y León (DiERCyL). Material y métodos. Estudio observacional retrospectivo realizado en 600 pacientes pediátricos de Castilla y León con trastornos del neurodesarrollo y otras anomalías fenotípicas a los que se les ha realizado aCGH desde 2018 hasta diciembre de 2022 en DiERCyL. Resultados. El rendimiento diagnóstico de los CGH arrays obtenido en este estudio es del 11,8%, siendo la alteración de la coordinación, la microcefalia y la epilepsia las manifestaciones clínicas con mejores tasas diagnósticas. Las provincias de las que proceden más pacientes y en las que, paralelamente, se ha obtenido un mayor número de CGH arrays patogénicos son León y Salamanca. Se detectaron variaciones en el número de copias (CNV) patogénicas en un total de 64 pacientes de toda Castilla y León, entre los cuales 43 (62,7%) fueron varones y 21 (32,8%) mujeres. Las deleciones fueron las CNVs más frecuentes, presentes en 41 pacientes (64,1%) y los cromosomas 15 y 16 resultaron ser los cromosomas donde se halló un mayor número de CNVs patogénicas, exactamente 9 (14,1%) en cada uno. Conclusiones. Se han realizado CGH arrays a pacientes procedentes de todas las provincias de Castilla y León, obteniéndose diferentes tasas diagnósticas en cada una de ellas, pero, en general, similares a las publicadas en la bibliografía. Las CNVs patogénicas han resultado ser predominantes en el sexo masculino y las más frecuentes son las deleciones. La prevalencia global de los síndromes diagnosticados es baja, aunque probablemente muchos de ellos estén infradiagnosticados.

[EN]Introduction. Array comparative genomic hybridisation (aCGH) is a molecular cytogenetic technique that has gained importance in recent years due to its high diagnostic yield in patients with global developmental delay/intellectual disability (GDD/ID), congenital malformations or autism spectrum disorders (ASD), all of them highly prevalent clinical entities that represent a serious sociohealth problem. Objectives. To analyse the requests and results of the array-CGH tests requested at the Advanced Diagnosis Unit of Rare Diseases of Castile and Leon (DiERCyL). Methods. Retrospective observational study conducted in 600 pediatric patients from Castile and Leon with neurodevelopmental disorders and other phenotypic abnormalities who underwent aCGH from 2018 to December 2022 in DiERCyL. Results. The diagnostic yield of the CGH arrays obtained in this study is 11.8%, with impaired coordination, microcephaly and epilepsy being the clinical features with the best diagnostic rates. The provinces with the highest number of patients and the highest number of pathogenic CGH arrays were León and Salamanca. Pathogenic copy number variations (CNV) were detected in a total of 64 patients from all over Castile and Leon, 43 (67.2%) of whom were males and 21 (32.8%) females. Deletions were the most frequent CNVs, present in 41 patients (64.1%) and chromosomes 15 and 16 were the chromosomes where the highest number of pathogenic CNVs were found, exactly 9 (14.1%) in each one. Conclusions. CGH arrays have been performed in patients from all provinces of Castile and Leon, obtaining different diagnostic rates in each of them, but, in general, similar to those published in the literature. Pathogenic CNVs were found to be predominant among men and the most frequent were deletions. The overall prevalence of the syndromes diagnosed is low, although many of them are probably underdiagnosed.